RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 GINS1Q14691 196 aa20.39■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 C7orf61Q8IZ16 206 aa20.39■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 JAGN1Q8N5M9 183 aa20.39■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 OR4E2Q8NGC2 313 aa20.39■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 ENAMQ9NRM1 1142 aa20.39■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 KCNK6Q9Y257 313 aa20.39■□□□□ 0.86
CCSAP-201ENST00000284617 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 LEFTY2O00292 366 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 KDELR2P33947 212 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 ALG1LQ6GMV1 187 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 SUSD1Q6UWL2 747 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 SNX29P2Q8IUI4 249 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 THAP6Q8TBB0 222 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 FAAHO00519 579 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 HTR1AP08908 422 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 GRIA2P42262 883 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM74Q86UV6 250 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM73Q86UV7 250 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 PSD4Q8NDX1 1056 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 TAS2R10Q9NYW0 307 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 RHCGQ9UBD6 479 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 HCN2Q9UL51 889 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 ALG5Q9Y673 324 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 CAPN14A8MX76 684 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 B4DGG1 531 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 BCKDHAP12694 445 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 AMZ1Q400G9 498 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 GALNT12Q8IXK2 581 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 TSTD1Q8NFU3 115 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 HCAR2Q8TDS4 363 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 PHOX2BQ99453 314 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF696Q9H7X3 374 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 GNG8Q9UK08 70 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 PEAK1Q9H792 1746 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 ANKFN1Q8N957 763 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 HMGB4Q8WW32 186 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 CREB3L1Q96BA8 519 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 NPIPA5E9PKD4 350 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 INPPL1O15357 1258 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 SHKBP1Q8TBC3 707 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 RAB8BQ92930 207 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 LRIG1Q96JA1 1093 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 NPIPA1Q9UND3 350 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 KCPQ6ZWJ8 1503 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 ISPDA4D126 451 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 FLRT2O43155 660 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 MAFKO60675 156 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 SLC19A2O60779 497 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 KDM4BO94953 1096 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 CSN2P05814 226 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 C8orf89P0DMQ9 161 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 HLCSP50747 726 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 FPGSQ05932 587 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 DNASE1L3Q13609 305 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 LY6G5CQ5SRR4 150 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 MTMR10Q9NXD2 777 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 A8MUA0 341 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 DENRO43583 198 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 CLUP10909 449 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 IVDP26440 423 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 THEM6Q8WUY1 208 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 NUDT15Q9NV35 164 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 COCHO43405 550 aa20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 AHSA1O95433 338 aa20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 RFC2P35250 354 aa20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 OR1E2P47887 323 aa20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 SLC27A4Q6P1M0 643 aa20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 CARM1Q86X55 608 aa20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 PIP5K1AQ99755 562 aa20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 FANCGO15287 622 aa20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 CHRNA1P02708 482 aa20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 GNSP15586 552 aa20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 HNF1BP35680 557 aa20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 SLC6A9P48067 706 aa20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 FXYD6Q9H0Q3 95 aa20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 CARD8Q9Y2G2 431 aa20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 L7N2F9 121 aa20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 C17orf62Q9BQA9 187 aa20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 PDYNP01213 254 aa20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 ACRV1P26436 265 aa20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 TEAD2Q15562 447 aa20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-201ENST00000284617 TRAM1L1Q8N609 369 aa20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms