RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284273.5

UBASH3B-201, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBASH3B, Length 6,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-201ENST00000284273 ATAD3CQ5T2N8 411 aa11.46□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 OR5M10Q6IEU7 315 aa11.46□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF765Q7L2R6 523 aa11.46□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 SMOQ99835 787 aa11.46□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 MYOGP15173 224 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 PFKLP17858 780 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 RGS19P49795 217 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 ABHD17BQ5VST6 288 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 C3orf33Q6P1S2 294 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 LRFN4Q6PJG9 635 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 CSNK1A1LQ8N752 337 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 TEX19Q8NA77 164 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 ARRDC3Q96B67 414 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF350Q9GZX5 532 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 FABP12A6NFH5 140 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 PDLIM1O00151 329 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 BEST1O76090 585 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 PRPS2P11908 318 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 CEBPBP17676 345 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF84P51523 738 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 AMIGO3Q86WK7 504 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 MARCH9Q86YJ5 346 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 TCEAL3Q969E4 200 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 TMEM74Q96NL1 305 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 EBF4Q9BQW3 602 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 GRHL1Q9NZI5 618 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 ACOT7O00154 380 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 RTCAO00442 366 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 RAD1O60671 282 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 PRKACGP22612 351 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 DSC3Q14574 896 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 LTC4SQ16873 150 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 OR8H3Q8N146 312 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 OR8H1Q8NGG4 311 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 OR51I1Q9H343 314 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 TLR4O00206 839 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 TP53I11O14683 189 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 KDM4BO94953 1096 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 ADORA3P0DMS8 318 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 HERVK_113P63132 956 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 MPP2Q14168 576 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 ERV3-1Q14264 604 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 XKRXQ6PP77 449 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 ASPGQ86U10 573 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 LGI4Q8N135 537 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 OR4K14Q8NGD5 310 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 PIP5K1AQ99755 562 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 FUCA2Q9BTY2 467 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 ERVK-6Q9BXR3 956 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 FLRT1Q9NZU1 646 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 IL20RAQ9UHF4 553 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 PRORSD1PA6NEY8 169 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 DEFB103AP81534 67 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 SHC2P98077 582 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 AIFM2Q9BRQ8 373 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 S100A14Q9HCY8 104 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 TAS2R9Q9NYW1 312 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM171A2A8MVW0 826 aa11.44□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 MERTKQ12866 999 aa11.44□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 SPIN4Q56A73 249 aa11.44□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 LYSMD4Q5XG99 296 aa11.44□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 GPR137CQ8N3F9 429 aa11.44□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 TTC9BQ8N6N2 239 aa11.44□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 CLEC1AQ8NC01 280 aa11.44□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 OR13C3Q8NGS6 347 aa11.44□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 PITX2Q99697 317 aa11.44□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa11.44□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 CSTAP01040 98 aa11.44□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 RLN2P04090 185 aa11.44□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 H2BFMP0C1H6 154 aa11.44□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 PLET1Q6UQ28 207 aa11.44□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 FUKQ8N0W3 1084 aa11.44□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 PQLC1Q8N2U9 271 aa11.44□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 FOXN4Q96NZ1 517 aa11.44□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 KCNK12Q9HB15 430 aa11.44□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 VDAC3Q9Y277 283 aa11.44□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 NUAK1O60285 661 aa11.44□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 LYPLA2O95372 231 aa11.44□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 BCKDHAP12694 445 aa11.44□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 CPOXP36551 454 aa11.44□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 GNG2P59768 71 aa11.44□□□□□ -0.58
UBASH3B-201ENST00000284273 BDH1Q02338 343 aa11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms