RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264187.6

NID1-201, Transcript of nidogen 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NID1, Length 5,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID1-201ENST00000264187 PREBQ9HCU5 417 aa14.6□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 CRTAC1Q9NQ79 661 aa14.6□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 CELP19835 753 aa14.6□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 TIGD5Q53EQ6 642 aa14.6□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 LIPKQ5VXJ0 399 aa14.6□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 TMEM225Q6GV28 225 aa14.6□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 ZER1Q7Z7L7 766 aa14.6□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 ERVK-19Q9WJR5 959 aa14.6□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 CFL1P23528 166 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 SLC6A6P31641 620 aa14.59□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 MAP2K4P45985 399 aa14.59□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 CDNFQ49AH0 187 aa14.59□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 GARNL3Q5VVW2 1013 aa14.59□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 CPT1CQ8TCG5 803 aa14.59□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa14.59□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 DLX3O60479 287 aa14.59□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 LYPLA2O95372 231 aa14.59□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 SMPD1P17405 629 aa14.59□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 FASLGP48023 281 aa14.59□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 NNATQ16517 81 aa14.59□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 PDSS1Q5T2R2 415 aa14.59□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 TXNDC8Q6A555 127 aa14.59□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 ELMOD2Q8IZ81 293 aa14.59□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 DBF4BQ8NFT6 615 aa14.59□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 RAD51DO75771 328 aa14.59□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 PTP4A2Q12974 167 aa14.59□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa14.59□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 CENPSQ8N2Z9 138 aa14.59□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 NLGN2Q8NFZ4 835 aa14.59□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 FCRL5Q96RD9 977 aa14.59□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 SYT4Q9H2B2 425 aa14.59□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 FN3KQ9H479 309 aa14.59□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 CDH10Q9Y6N8 788 aa14.59□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 A6NLC8 198 aa14.59□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 ABRAXAS2Q15018 415 aa14.59□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 SLC10A6Q3KNW5 377 aa14.59□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 CYBRD1Q53TN4 286 aa14.59□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 C12orf40Q86WS4 652 aa14.59□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 C4orf32Q8N8J7 132 aa14.59□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 DLGAP1O14490 977 aa14.59□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 LATS1O95835 1130 aa14.59□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 ASPAP45381 313 aa14.59□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 PTCHD3Q3KNS1 767 aa14.59□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 ZNF584Q8IVC4 421 aa14.59□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 TMEM246Q9BRR3 403 aa14.59□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa14.59□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 FPR1P21462 350 aa14.58□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 F8A1P23610 371 aa14.58□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 PREPP48147 710 aa14.58□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 DPY19L4Q7Z388 723 aa14.58□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 TMEM139Q8IV31 216 aa14.58□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 CNIH3Q8TBE1 160 aa14.58□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 C17orf62Q9BQA9 187 aa14.58□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 WDR45Q9Y484 360 aa14.58□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa14.58□□□□□ -0.07
NID1-201ENST00000264187 SLC22A2O15244 555 aa14.58□□□□□ -0.08
NID1-201ENST00000264187 IFNA5P01569 189 aa14.58□□□□□ -0.08
NID1-201ENST00000264187 KLRG1Q96E93 195 aa14.58□□□□□ -0.08
NID1-201ENST00000264187 FBXL12Q9NXK8 326 aa14.58□□□□□ -0.08
NID1-201ENST00000264187 CLDND1Q9NY35 253 aa14.58□□□□□ -0.08
NID1-201ENST00000264187 EPHA6Q9UF33 1036 aa14.58□□□□□ -0.08
NID1-201ENST00000264187 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
NID1-201ENST00000264187 GALK2Q01415 458 aa14.58□□□□□ -0.08
NID1-201ENST00000264187 PTPRCAPQ14761 206 aa14.58□□□□□ -0.08
NID1-201ENST00000264187 FAM189A2Q15884 450 aa14.58□□□□□ -0.08
NID1-201ENST00000264187 GPR33Q49SQ1 333 aa14.58□□□□□ -0.08
NID1-201ENST00000264187 FBXL22Q6P050 247 aa14.58□□□□□ -0.08
NID1-201ENST00000264187 VGLL2Q8N8G2 317 aa14.58□□□□□ -0.08
NID1-201ENST00000264187 MCHR1Q99705 422 aa14.58□□□□□ -0.08
NID1-201ENST00000264187 BTBD1Q9H0C5 482 aa14.58□□□□□ -0.08
NID1-201ENST00000264187 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
NID1-201ENST00000264187 ZIM2Q9NZV7 527 aa14.58□□□□□ -0.08
NID1-201ENST00000264187 PDYNP01213 254 aa14.58□□□□□ -0.08
NID1-201ENST00000264187 GNB3P16520 340 aa14.58□□□□□ -0.08
NID1-201ENST00000264187 GLDCP23378 1020 aa14.58□□□□□ -0.08
NID1-201ENST00000264187 TUBA1BP68363 451 aa14.58□□□□□ -0.08
NID1-201ENST00000264187 MVKQ03426 396 aa14.58□□□□□ -0.08
NID1-201ENST00000264187 KCNC4Q03721 635 aa14.58□□□□□ -0.08
NID1-201ENST00000264187 PMS2P3Q13401 168 aa14.58□□□□□ -0.08
NID1-201ENST00000264187 TATDN1Q6P1N9 297 aa14.58□□□□□ -0.08
NID1-201ENST00000264187 CFAP77Q6ZQR2 320 aa14.58□□□□□ -0.08
NID1-201ENST00000264187 TUBA1AQ71U36 451 aa14.58□□□□□ -0.08
NID1-201ENST00000264187 KIF18BQ86Y91 864 aa14.58□□□□□ -0.08
NID1-201ENST00000264187 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
NID1-201ENST00000264187 TMEM125Q96AQ2 219 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms