RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249499.7

HOXD9-201, Transcript of homeobox D9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD9, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9-201ENST00000249499 PPP2CAP67775 309 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXD9-201ENST00000249499 SPIDRQ14159 915 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXD9-201ENST00000249499 TMEM35AQ53FP2 167 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXD9-201ENST00000249499 EOGTQ5NDL2 527 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXD9-201ENST00000249499 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP21.85■■□□□ 1.09
HOXD9-201ENST00000249499 NAGSQ8N159 534 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXD9-201ENST00000249499 OR52E1Q8NGJ3 308 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXD9-201ENST00000249499 TM4SF18Q96CE8 201 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXD9-201ENST00000249499 MRGPRX1Q96LB2 322 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXD9-201ENST00000249499 SARGQ9BW04 601 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXD9-201ENST00000249499 SLC6A16Q9GZN6 736 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXD9-201ENST00000249499 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
HOXD9-201ENST00000249499 TMEM184CQ9NVA4 438 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXD9-201ENST00000249499 MOSPD1Q9UJG1 213 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXD9-201ENST00000249499 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXD9-201ENST00000249499 SLC31A1O15431 190 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXD9-201ENST00000249499 NDUFS4O43181 175 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXD9-201ENST00000249499 AHCYL1O43865 530 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXD9-201ENST00000249499 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
HOXD9-201ENST00000249499 RAD23AP54725 363 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXD9-201ENST00000249499 NFATC4Q14934 902 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXD9-201ENST00000249499 RPE65Q16518 533 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXD9-201ENST00000249499 FBXO43Q4G163 708 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXD9-201ENST00000249499 GCNT6Q5T4J0 391 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF555Q8NEP9 628 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXD9-201ENST00000249499 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
HOXD9-201ENST00000249499 HSH2DQ96JZ2 352 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXD9-201ENST00000249499 F2RL3Q96RI0 385 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXD9-201ENST00000249499 FGF22Q9HCT0 170 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXD9-201ENST00000249499 FZD3Q9NPG1 666 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXD9-201ENST00000249499 GPATCH2Q9NW75 528 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXD9-201ENST00000249499 TAAR2Q9P1P5 351 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXD9-201ENST00000249499 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
HOXD9-201ENST00000249499 OR1F1O43749 312 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXD9-201ENST00000249499 APBB3O95704 486 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXD9-201ENST00000249499 NTRK1P04629 796 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXD9-201ENST00000249499 UQCRC2P22695 453 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXD9-201ENST00000249499 GRK3P35626 688 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXD9-201ENST00000249499 IST1P53990 364 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXD9-201ENST00000249499 CCDC80Q76M96 950 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXD9-201ENST00000249499 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXD9-201ENST00000249499 TBC1D19Q8N5T2 526 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXD9-201ENST00000249499 OR5P2Q8WZ92 322 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXD9-201ENST00000249499 TOR3AQ9H497 397 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXD9-201ENST00000249499 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
HOXD9-201ENST00000249499 NEUROD4Q9HD90 331 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXD9-201ENST00000249499 ORC6Q9Y5N6 252 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXD9-201ENST00000249499 UNC80Q8N2C7 3258 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXD9-201ENST00000249499 A0A1B0GTW7 788 aa21.83■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 SUV39H1O43463 412 aa21.83■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 LATO43561 262 aa21.83■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 NUDT7P0C024 238 aa21.83■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 GLULP15104 373 aa21.83■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 NELFEP18615 380 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 CRATP43155 626 aa21.83■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 RPS6KA3P51812 740 aa21.83■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 ITGA1P56199 1179 aa21.83■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 CYP4F2P78329 520 aa21.83■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 IL18R1Q13478 541 aa21.83■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 TMEM26Q6ZUK4 368 aa21.83■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 ARL10Q8N8L6 244 aa21.83■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 CREB3L4Q8TEY5 395 aa21.83■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 NRTNQ99748 197 aa21.83■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 DOHHQ9BU89 302 aa21.83■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 TRIM4Q9C037 500 aa21.83■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 C1GALT1Q9NS00 363 aa21.83■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 FAM118AQ9NWS6 357 aa21.83■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa21.83■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 FEZF1A0PJY2 475 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 TNFRSF10CO14798 259 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 FPR1P21462 350 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 AHRP35869 848 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 FRKP42685 505 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 C16orf72Q14CZ0 275 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 MSANTD3Q96H12 275 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 WDR92Q96MX6 357 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 SMURF2Q9HAU4 748 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 PADI2Q9Y2J8 665 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 BRWD1Q9NSI6 2320 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 FKBP9O95302 570 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 CLIC3O95833 236 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 GSTT1P30711 240 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 ZIC1Q15915 447 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 THAP5Q7Z6K1 395 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 OFCC1Q8IZS5 231 aa21.81■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 MBOAT4Q96T53 435 aa21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.7 ms