RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 JUNDP17535 347 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 DCTP40126 519 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 GP2P55259 537 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 MVKQ03426 396 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 CYP2A13Q16696 494 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 DPY19L1Q2PZI1 675 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 CACHD1Q5VU97 1274 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 SPESP1Q6UW49 350 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF765Q7L2R6 523 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 PARGQ86W56 976 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 ARL10Q8N8L6 244 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 RORBQ92753 470 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 LRP4O75096 1905 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 DFNA5O60443 496 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 NIPSNAP2O75323 286 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 PIGAP37287 484 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 TMED10P49755 219 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 DGKQP52824 942 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 ALG11Q2TAA5 492 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM151BQ6UXP7 276 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 MACC1Q6ZN28 852 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 SLCO6A1Q86UG4 719 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM9CQ8IZT9 166 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 OR4F6Q8NGB9 312 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 OR10A6Q8NH74 314 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 OR1E3Q8WZA6 343 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 DGCR6LQ9BY27 220 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 DHRS7Q9Y394 339 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 CCL27Q9Y4X3 112 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 M0R3G1 203 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 OR7A17O14581 309 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 TM4SF5O14894 197 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 HS6ST1O60243 411 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 ERN1O75460 977 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 MC4RP32245 332 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 DOK6Q6PKX4 331 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 MILR1Q7Z6M3 343 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC25A45Q8N413 288 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM174AQ8TBP5 190 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 NETO1Q8TDF5 533 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 SAP25Q8TEE9 199 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 FKBPLQ9UIM3 349 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 BCKDKO14874 412 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 STX7O15400 261 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 SH3BP5O60239 455 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 E2F6O75461 281 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 CSF2P04141 144 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 ACVR2AP27037 513 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 RXRGP48443 463 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 CDK5R2Q13319 367 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 C1orf61Q13536 156 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 KEAP1Q14145 624 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 LAIR2Q6ISS4 152 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 NLRP8Q86W28 1048 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 SVOPQ8N4V2 548 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 FAR1Q8WVX9 515 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 RHBDF1Q96CC6 855 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 DPY30Q9C005 99 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 NOBOXO60393 691 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 PRKD3O94806 890 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC2A4P14672 509 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 HPCAL1P37235 193 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 HTR6P50406 440 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 CLCN7P51798 805 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 LIMK1P53667 647 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 CHRNA6Q15825 494 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 NKG7Q16617 165 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM86B1Q8N7N1 296 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR92Q96MX6 357 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 EPS8L2Q9H6S3 715 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 KCTD5Q9NXV2 234 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 SCN3BQ9NY72 215 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 PKP3Q9Y446 797 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 ASB1Q9Y576 335 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 MTX2O75431 263 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 CREG1O75629 220 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 CEACAM5P06731 702 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 NME1P15531 152 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-201ENST00000246533 KIAA1024LP59773 190 aa25.23■■□□□ 1.63
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