RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 EMC8O43402 210 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 GRID2O43424 1007 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 ATG12O94817 140 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 FARS2O95363 451 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 CFIP05156 583 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 DBIP07108 87 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 FBLP22087 321 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 FOXN2P32314 431 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 KCNC1P48547 511 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 GSK3BP49841 420 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 RPS24P62847 133 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 CDKL1Q00532 357 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 PCLAFQ15004 111 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 ZNF181Q2M3W8 571 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 GFOD2Q3B7J2 385 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 ZNF613Q6PF04 617 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 SYCE2Q6PIF2 218 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 HSDL2Q6YN16 418 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 RTL10Q7L3V2 364 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 NLGN2Q8NFZ4 835 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 ZNF461Q8TAF7 563 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 C17orf62Q9BQA9 187 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 HERPUD2Q9BSE4 406 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 HOXD1Q9GZZ0 328 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 SLC6A15Q9H2J7 730 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 TPT1P8Q9HAU6 139 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 PRKYO43930 277 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 UGT1A9O60656 530 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 TMBIM6P55061 237 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 SELENOVP59797 346 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 RHDQ02161 417 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 EVX2Q03828 476 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 MAB21L1Q13394 359 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 MOGQ16653 247 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 FAM214AQ32MH5 1076 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 AMZ1Q400G9 498 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 KLHDC10Q6PID8 442 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 SLC2A7Q6PXP3 512 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 RABEPKQ7Z6M1 372 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 TRIM74Q86UV6 250 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 TRIM73Q86UV7 250 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 OSTM1Q86WC4 334 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 SLC15A3Q8IY34 581 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 MFSD2AQ8NA29 543 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 SMPDL3BQ92485 455 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 NKD1Q969G9 470 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 BIRC7Q96CA5 298 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 KLHDC7BQ96G42 594 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 CDK15Q96Q40 435 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 UGT1A7Q9HAW7 530 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 UGT1A10Q9HAW8 530 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 UGT1A8Q9HAW9 530 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa6.97□□□□□ -1.29
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CPS1-201ENST00000233072 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 TRIM64A6NGJ6 449 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 J3KR12 359 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 M0R129 80 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 FGF18O76093 207 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 PRKD3O94806 890 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 CLDN7O95471 211 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 C6orf47O95873 294 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 FESP07332 822 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 HCKP08631 526 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 GSTT2P0CG29 244 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 HTR1EP28566 365 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 ACVRL1P37023 503 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 GPRC6AQ5T6X5 926 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 CYS1Q717R9 158 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 ZNF101Q8IZC7 436 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
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CPS1-201ENST00000233072 ITFG2Q969R8 447 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 PIP5K1AQ99755 562 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 BCL7BQ9BQE9 202 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 SYT17Q9BSW7 474 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 ADAMTS10Q9H324 1103 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 MARCH7Q9H992 704 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 PDE7BQ9NP56 450 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 TBCCD1Q9NVR7 557 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 CLDND1Q9NY35 253 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa6.97□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 HRGP04196 525 aa6.96□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 NUDT1P36639 197 aa6.96□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 GPX6P59796 221 aa6.96□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 RCAN2Q14206 197 aa6.96□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 SLC14A2Q15849 920 aa6.96□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 ALKBH2Q6NS38 261 aa6.96□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 Q6ZVU0 165 aa6.96□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 SERINC5Q86VE9 423 aa6.96□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 TMEM156Q8N614 296 aa6.96□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 SHKBP1Q8TBC3 707 aa6.96□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 SLC22A8Q8TCC7 542 aa6.96□□□□□ -1.29
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