RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229265.10

CDCA3-201, Transcript of cell division cycle associated 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDCA3, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3-201ENST00000229265 DFNA5O60443 496 aa10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF217O75362 1048 aa10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 CREG1O75629 220 aa10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 SEMA4FO95754 770 aa10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 LYNP07948 512 aa10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 PCNAP12004 261 aa10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 DRD2P14416 443 aa10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 ATP6V1B2P21281 511 aa10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 AHRP35869 848 aa10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 RPS6KA3P51812 740 aa10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 WNT3P56703 355 aa10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 RPS13P62277 151 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 RAE1P78406 368 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 VAC14Q08AM6 782 aa10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 FOXC1Q12948 553 aa10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 PDE7AQ13946 482 aa10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 GK3PQ14409 553 aa10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 HEPACAMQ14CZ8 416 aa10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 MLC1Q15049 377 aa10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 PDK3Q15120 406 aa10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 UGT8Q16880 541 aa10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 PGS1Q32NB8 556 aa10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 CATSPEREQ5SY80 951 aa10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 FAM71E1Q6IPT2 247 aa10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 CRTC3Q6UUV7 619 aa10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 SLC36A4Q6YBV0 504 aa10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 TMPRSS11BQ86T26 416 aa10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 TRIM74Q86UV6 250 aa10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 IFNEQ86WN2 208 aa10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 SVOPLQ8N434 492 aa10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 METTL25Q8N6Q8 603 aa10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 OR5AR1Q8NGP9 310 aa10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 OR10A6Q8NH74 314 aa10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 SNX19Q92543 992 aa10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 RGMAQ96B86 450 aa10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 RNF145Q96MT1 663 aa10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 PANX1Q96RD7 426 aa10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 CHID1Q9BWS9 393 aa10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 COQ10BQ9H8M1 238 aa10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 PRDM9Q9NQV7 894 aa10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 DNAJB9Q9UBS3 223 aa10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 EGFL7Q9UHF1 273 aa10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 VPS4AQ9UN37 437 aa10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa10.2□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 DSPP15924 2871 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa10.19□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 FAM221BA6H8Z2 402 aa10.19□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 H0YAE9 185 aa10.19□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 CXCR6O00574 342 aa10.19□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 PCDH7O60245 1069 aa10.19□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 NDUFS2O75306 463 aa10.19□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 RASAL1O95294 804 aa10.19□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 TNFAIP8O95379 198 aa10.19□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 HPRP00739 348 aa10.19□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 MYF5P13349 255 aa10.19□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 TACR1P25103 407 aa10.19□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 AKT2P31751 481 aa10.19□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 SHMT2P34897 504 aa10.19□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 CHN2P52757 468 aa10.19□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 AQP4P55087 323 aa10.19□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 OR4D2P58180 307 aa10.19□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 FADDQ13158 208 aa10.19□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 KRT33BQ14525 404 aa10.19□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 NFATC4Q14934 902 aa10.19□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 LRRC36Q1X8D7 754 aa10.19□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 HLA-BQ31612 363 aa10.19□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 NHSL2Q5HYW2 709 aa10.19□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 MANEAQ5SRI9 462 aa10.19□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 TMEM154Q6P9G4 183 aa10.19□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF621Q6ZSS3 439 aa10.19□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 SLC9B2Q86UD5 537 aa10.19□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 GATAD2AQ86YP4 633 aa10.19□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 MSRB3Q8IXL7 192 aa10.19□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 DTWD1Q8N5C7 304 aa10.19□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 ZFP28Q8NHY6 868 aa10.19□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 NCLNQ969V3 563 aa10.19□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 THAP11Q96EK4 314 aa10.19□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 NRBF2Q96F24 287 aa10.19□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 PYURFQ96I23 114 aa10.19□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 EGLN2Q96KS0 407 aa10.19□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 WDR92Q96MX6 357 aa10.19□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 MYOCQ99972 504 aa10.19□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 PCED1AQ9H1Q7 454 aa10.19□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 FZD3Q9NPG1 666 aa10.19□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 EHD3Q9NZN3 535 aa10.19□□□□□ -0.78
CDCA3-201ENST00000229265 ANKMY1Q9P2S6 941 aa10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.8 ms