RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 ALPPP05187 535 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 PRF1P14222 555 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 FOLR3P41439 243 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 AP1S2P56377 157 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 RPA4Q13156 261 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC9A5Q14940 896 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR135Q8IZ08 494 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 TCAIMQ8N3R3 496 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 OR5AR1Q8NGP9 310 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 UBTD2Q8WUN7 234 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 C17orf62Q9BQA9 187 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 PDZD2O15018 2839 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC22O60826 627 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 KITP10721 976 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 ACADLP28330 430 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 GGT5P36269 586 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 DCDP81605 110 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 LCP2Q13094 533 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC22A15Q8IZD6 547 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 DNAJC22Q8N4W6 341 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 FITM2Q8N6M3 262 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 TUBB6Q9BUF5 446 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 HEY2Q9UBP5 337 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-216ENST00000628306 TRPC5OSA6NMA1 111 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
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CAPNS1-216ENST00000628306 IDH3AP50213 366 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 CLCQ05315 142 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 IGFL2Q6UWQ7 119 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 CLYBLQ8N0X4 340 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 ZADH2Q8N4Q0 377 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 MCOLN3Q8TDD5 553 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 MYLK2Q9H1R3 596 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 ZGRF1Q86YA3 2104 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 PEX12O00623 359 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 IGHEP01854 428 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 ANXA5P08758 320 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 HIST1H2ADP20671 130 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.269e-8■■■■■ 39.8
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CAPNS1-216ENST00000628306 DLG3Q92796 817 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 RHBDF1Q96CC6 855 aa22.94■■□□□ 1.26
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CAPNS1-216ENST00000628306 HIST1H2AJQ99878 128 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 H2AFJQ9BTM1 129 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC28BQ9BUN5 200 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC6A20Q9NP91 592 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 PCTPQ9UKL6 214 aa22.94■■□□□ 1.26
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CAPNS1-216ENST00000628306 SVILO95425 2214 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 MAP3K7O43318 606 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 ALOX12BO75342 701 aa22.93■■□□□ 1.26
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CAPNS1-216ENST00000628306 ATXN8OSP0DMR3 200 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 PKNOX1P55347 436 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 EXT2Q93063 718 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa22.93■■□□□ 1.26
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CAPNS1-216ENST00000628306 ABCF3Q9NUQ8 709 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 NDOR1Q9UHB4 597 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 PDE10AQ9Y233 779 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP5HO75947 161 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 ONECUT2O95948 504 aa22.92■■□□□ 1.26
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CAPNS1-216ENST00000628306 PIK3CGP48736 1102 aa22.92■■□□□ 1.26
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CAPNS1-216ENST00000628306 PHKG1Q16816 387 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 SYTL3Q4VX76 610 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 VRK3Q8IV63 474 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 TM9SF4Q92544 642 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 MOCOSQ96EN8 888 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 CCT7Q99832 543 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 CD244Q9BZW8 370 aa22.92■■□□□ 1.26
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