RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597423.1

TRIM28-209, Transcript of tripartite motif containing 28, humanhuman

TSL 3

Gene TRIM28, Length 733 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28-209ENST00000597423 ZNF763Q0D2J5 394 aa14.52□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 SPIDRQ14159 915 aa14.52□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 SLC9A5Q14940 896 aa14.52□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 DPY19L1Q2PZI1 675 aa14.52□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 FAM214AQ32MH5 1076 aa14.52□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 MMEL1Q495T6 779 aa14.52□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 GARNL3Q5VVW2 1013 aa14.52□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 FRMPD2BQ6IN97 320 aa14.52□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa14.52□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 TREML1Q86YW5 311 aa14.52□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 OR4N4Q8N0Y3 316 aa14.52□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa14.52□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 D2HGDHQ8N465 521 aa14.52□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa14.52□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 FCRL4Q96PJ5 515 aa14.52□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 TSSK3Q96PN8 268 aa14.52□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 C17orf62Q9BQA9 187 aa14.52□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 NUDT22Q9BRQ3 303 aa14.52□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 FAIM2Q9BWQ8 316 aa14.52□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 EBPLQ9BY08 206 aa14.52□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 KLHL31Q9H511 634 aa14.52□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 FAM60AQ9NP50 221 aa14.52□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 ARL8BQ9NVJ2 186 aa14.52□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 FAM86C1Q9NVL1 165 aa14.52□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa14.52□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa14.52□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 NDUFAF1Q9Y375 327 aa14.52□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa14.52□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 SLC22A7Q9Y694 548 aa14.52□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 A0A1W2PQM1 296 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 CCDC154A6NI56 674 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 PROB1E7EW31 1015 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 DLL1O00548 723 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 CFLARO15519 480 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 UNC5CO95185 931 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 CDK4P11802 303 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 BSGP35613 385 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 SEPHS1P49903 392 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 MTTPP55157 894 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 C21orf58P58505 322 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 RAE1P78406 368 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 BTN3A2P78410 334 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 MXRA7P84157 204 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 ACY1Q03154 408 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 HYAL2Q12891 473 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 ART3Q13508 389 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 GRM7Q14831 915 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 HEPACAMQ14CZ8 416 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 SNX32Q86XE0 403 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 GPR135Q8IZ08 494 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 NATD1Q8N6N6 113 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 KCT2Q8NC54 265 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 VPS37AQ8NEZ2 397 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 PROKR1Q8TCW9 393 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 C16orf78Q8WTQ4 265 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 MTERF3Q96E29 417 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 SERINC2Q96SA4 455 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 PRDM7Q9NQW5 492 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 ATAD3AQ9NVI7 634 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 NDE1Q9NXR1 346 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 SPACA6W5XKT8 324 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 A0A1W2PP18 115 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 ANGPT2O15123 496 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 B3GALT2O43825 422 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 CBX6O95503 412 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 SMIM10L1P0DMW3 83 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 ALOX12P18054 663 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 S100A3P33764 101 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 RAB8AP61006 207 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 C2orf80Q0P641 193 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 SLAMF1Q13291 335 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 PTGR1Q14914 329 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 COQ5Q5HYK3 327 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 TLDC1Q6P9B6 456 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 UBE3DQ7Z6J8 389 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 ACOT4Q8N9L9 421 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 OR8K5Q8NH50 307 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 CDC26Q8NHZ8 85 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 TESCQ96BS2 214 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 SPDL1Q96EA4 605 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 SMIM10Q96HG1 83 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 ZNF285Q96NJ3 590 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 TMEM74Q96NL1 305 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 MACROD1Q9BQ69 325 aa14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms