RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597315.5

BRD4-208, Transcript of bromodomain containing 4, humanhuman

TSL 5

Gene BRD4, Length 892 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4-208ENST00000597315 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 EFCAB3Q8N7B9 438 aa25.42■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 ISL2Q96A47 359 aa25.42■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 WDR34Q96EX3 536 aa25.42■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 ZNF700Q9H0M5 742 aa25.42■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 L2HGDHQ9H9P8 463 aa25.42■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 COPG2Q9UBF2 871 aa25.42■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 TMCO1Q9UM00 188 aa25.42■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa25.41■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 FAM153BP0C7A2 387 aa25.41■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 RNH1P13489 461 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 MTHFD2P13995 350 aa25.41■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 KCNC4Q03721 635 aa25.41■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 HYAL2Q12891 473 aa25.41■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 NSDHLQ15738 373 aa25.41■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 FAM153CQ494X1 144 aa25.41■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 CNPY4Q8N129 248 aa25.41■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 PNPLA2Q96AD5 504 aa25.41■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 MTBPQ96DY7 904 aa25.41■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 RHBGQ9H310 441 aa25.41■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 ASB1Q9Y576 335 aa25.41■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 A0A1W2PQ72 361 aa25.4■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 LRIT2A6NDA9 550 aa25.4■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 B4GALT2O60909 372 aa25.4■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 SMIM24O75264 130 aa25.4■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 SERPINA7P05543 415 aa25.4■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 PCNAP12004 261 aa25.4■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 MAGEA12P43365 314 aa25.4■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 PIK3CGP48736 1102 aa25.4■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 MLLT10P55197 1068 aa25.4■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 Q0VFX4 171 aa25.4■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 ABRAXAS2Q15018 415 aa25.4■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 TECRLQ5HYJ1 363 aa25.4■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 SLC6A19Q695T7 634 aa25.4■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 MED27Q6P2C8 311 aa25.4■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 IGFL3Q6UXB1 125 aa25.4■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 ISLR2Q6UXK2 745 aa25.4■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa25.4■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 LANCL3Q6ZV70 420 aa25.4■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 LRRN4CLQ8ND94 238 aa25.4■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 MAP10Q9P2G4 905 aa25.4■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa25.39■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 B3GALT2O43825 422 aa25.39■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 PRR35P0CG20 571 aa25.39■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 SMIM10L1P0DMW3 83 aa25.39■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 CASP2P42575 452 aa25.39■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 PLA2G16P53816 162 aa25.39■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 SLC29A2Q14542 456 aa25.39■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 PCOLCEQ15113 449 aa25.39■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 PLPP5Q8NEB5 264 aa25.39■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 ARMC2Q8NEN0 867 aa25.39■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 OR2L5Q8NG80 312 aa25.39■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 MS4A6EQ96DS6 147 aa25.39■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 SMIM10Q96HG1 83 aa25.39■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 GPR78Q96P69 363 aa25.39■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 ACTR8Q9H981 624 aa25.39■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 ZNF358Q9NW07 568 aa25.39■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa25.39■■□□□ 1.66
BRD4-208ENST00000597315 A0A0G2JN53 185 aa25.38■■□□□ 1.65
BRD4-208ENST00000597315 MAGEB17A8MXT2 336 aa25.38■■□□□ 1.65
BRD4-208ENST00000597315 PRAMEF4O60810 478 aa25.38■■□□□ 1.65
BRD4-208ENST00000597315 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
BRD4-208ENST00000597315 EPORP19235 508 aa25.38■■□□□ 1.65
BRD4-208ENST00000597315 SERPINB1P30740 379 aa25.38■■□□□ 1.65
BRD4-208ENST00000597315 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
BRD4-208ENST00000597315 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP25.38■■□□□ 1.651e-6■■■■■ 27.4
BRD4-208ENST00000597315 CRB2Q5IJ48 1285 aa25.38■■□□□ 1.65
BRD4-208ENST00000597315 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa25.38■■□□□ 1.65
BRD4-208ENST00000597315 ADGRD1Q6QNK2 874 aa25.38■■□□□ 1.65
BRD4-208ENST00000597315 LINC00696Q6ZRV3 163 aa25.38■■□□□ 1.65
BRD4-208ENST00000597315 ANKRD37Q7Z713 158 aa25.38■■□□□ 1.65
BRD4-208ENST00000597315 ATCAYQ86WG3 371 aa25.38■■□□□ 1.65
BRD4-208ENST00000597315 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
BRD4-208ENST00000597315 ATP6V1E2Q96A05 226 aa25.38■■□□□ 1.65
BRD4-208ENST00000597315 PTCHD1Q96NR3 888 aa25.38■■□□□ 1.65
BRD4-208ENST00000597315 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
BRD4-208ENST00000597315 LUZP4Q9P127 313 aa25.38■■□□□ 1.65
BRD4-208ENST00000597315 XPR1Q9UBH6 696 aa25.38■■□□□ 1.65
BRD4-208ENST00000597315 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa25.37■■□□□ 1.65
BRD4-208ENST00000597315 OR2W5A6NFC9 320 aa25.37■■□□□ 1.65
BRD4-208ENST00000597315 KLK8O60259 260 aa25.37■■□□□ 1.65
BRD4-208ENST00000597315 PRMT3O60678 531 aa25.37■■□□□ 1.65
BRD4-208ENST00000597315 CD22P20273 847 aa25.37■■□□□ 1.65
BRD4-208ENST00000597315 OR4D2P58180 307 aa25.37■■□□□ 1.65
BRD4-208ENST00000597315 PHEXP78562 749 aa25.37■■□□□ 1.65
BRD4-208ENST00000597315 GTF2H2Q13888 395 aa25.37■■□□□ 1.65
BRD4-208ENST00000597315 RCN2Q14257 317 aa25.37■■□□□ 1.65
BRD4-208ENST00000597315 BTBD16Q32M84 506 aa25.37■■□□□ 1.65
BRD4-208ENST00000597315 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms