RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588516.5

NEDD4L-223, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 5

Gene NEDD4L, Length 1,304 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-223	ENST00000588516	VRK3	Q8IV63	474 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	LAS2	Q8IYD9	372 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	SLC15A4	Q8N697	577 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	OR7G3	Q8NG95	312 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	TPD52L3	Q96J77	140 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	EGLN2	Q96KS0	407 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	EBPL	Q9BY08	206 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	THSD1	Q9NS62	852 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	TDP1	Q9NUW8	608 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	BPTF	Q12830	3046 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	C1orf226	A1L170	272 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	SAGE2P	A6NJ88	616 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	GABRR3	A8MPY1	467 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516		E7EQ34	232 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	PI15	O43692	258 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	FGF18	O76093	207 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	INMT	O95050	263 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	PRNP	P04156	253 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	ELFN1	P0C7U0	828 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	LINC00271	P0C7V0	271 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	C1GALT1C1L	P0DN25	315 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	TYR	P14679	529 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	CD247	P20963	164 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	CXCR2	P25025	360 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	ACVR2A	P27037	513 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	KRT20	P35900	424 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	GGT2	P36268	569 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	HSD17B2	P37059	387 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	CD97	P48960	835 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	ALDH9A1	P49189	494 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	ITGAD	Q13349	1161 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	CAMK1	Q14012	370 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	CLCA4	Q14CN2	919 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516		Q6ZVL8	140 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	TMEM25	Q86YD3	366 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	KRT78	Q8N1N4	520 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	CHST14	Q8NCH0	376 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	CDC26	Q8NHZ8	85 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	TANK	Q92844	425 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	SLC38A4	Q969I6	547 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	PPCDC	Q96CD2	204 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	AP2M1	Q96CW1	435 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	QRFPR	Q96P65	431 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	PKP4	Q99569	1192 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	PSD2	Q9BQI7	771 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	ITPA	Q9BY32	194 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	CHST8	Q9H2A9	424 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	MYNN	Q9NPC7	610 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	CD84	Q9UIB8	345 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516		E9PQ18	207 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	HAX1	O00165	279 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	TSPAN6	O43657	245 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	LEFTY1	O75610	366 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	RPN2	P04844	631 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	CDH3	P22223	829 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	PSMB9	P28065	219 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	BCAP31	P51572	246 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NEDD4L-223	ENST00000588516	VLDLR	P98155	873 aa		13.48	□□□□□ -0.25

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