RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584538.1

USP22-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, human

TSL 4

Gene USP22, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP22-211	ENST00000584538	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	SH3GL2	Q99962	352 aa		11.23	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		11.23	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		11.23	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		11.23	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		11.23	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		11.23	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		11.23	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		11.23	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		11.22	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538		A0A0G2JN53	185 aa		11.22	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		11.22	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		11.22	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	ERI3	O43414	337 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	JRK	O75564	520 aa		11.22	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	MYZAP	P0CAP1	466 aa		11.22	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		11.22	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	PRKAR1A	P10644	381 aa		11.22	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	PCNA	P12004	261 aa		11.22	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	AVPR1B	P47901	424 aa		11.22	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	NAGLU	P54802	743 aa		11.22	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	PKNOX1	P55347	436 aa		11.22	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	STXBP1	P61764	594 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	OLR1	P78380	273 aa		11.22	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	RBBP7	Q16576	425 aa		11.22	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	UGT8	Q16880	541 aa		11.22	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	MLIP	Q5VWP3	458 aa		11.22	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	KHDRBS2	Q5VWX1	349 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	FRG2	Q64ET8	278 aa		11.22	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		11.22	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	ABHD13	Q7L211	337 aa		11.22	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		11.22	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		11.22	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	CCDC63	Q8NA47	563 aa		11.22	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		11.22	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	CCT6B	Q92526	530 aa		11.22	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	TTC9	Q92623	222 aa		11.22	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	ARL8A	Q96BM9	186 aa		11.22	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	FRG2B	Q96QU4	278 aa		11.22	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	F2RL3	Q96RI0	385 aa		11.22	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		11.22	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		11.22	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	CENPH	Q9H3R5	247 aa		11.22	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		11.22	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	LANCL2	Q9NS86	450 aa		11.22	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	C14orf105	Q9NVL8	296 aa		11.22	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	WDR70	Q9NW82	654 aa		11.22	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		11.22	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	NXT1	Q9UKK6	140 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	PADI2	Q9Y2J8	665 aa		11.22	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538		A0A1W2PQ72	361 aa		11.21	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	PLPP1	O14494	284 aa		11.21	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	TM9SF1	O15321	606 aa		11.21	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	BMP10	O95393	424 aa		11.21	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	MLYCD	O95822	493 aa		11.21	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	BPGM	P07738	259 aa		11.21	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		11.21	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	CERS1	P27544	350 aa		11.21	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	FOLR3	P41439	243 aa		11.21	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	SERPINB4	P48594	390 aa		11.21	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	NEK2	P51955	445 aa		11.21	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	FOXA1	P55317	472 aa		11.21	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	NAA20	P61599	178 aa		11.21	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	KLC1	Q07866	573 aa		11.21	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	TTMP	Q5BVD1	217 aa		11.21	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	VWA2	Q5GFL6	755 aa		11.21	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	AGBL2	Q5U5Z8	902 aa		11.21	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		11.21	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	PCSK4	Q6UW60	755 aa		11.21	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		11.21	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		11.21	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		11.21	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	CA13	Q8N1Q1	262 aa		11.21	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		11.21	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		11.21	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	COL26A1	Q96A83	441 aa		11.21	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	REPS1	Q96D71	796 aa		11.21	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		11.21	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	KCNA7	Q96RP8	456 aa		11.21	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		11.21	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	OR51B5	Q9H339	312 aa		11.21	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		11.21	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
USP22-211	ENST00000584538	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		11.21	□□□□□ -0.61

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