RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 STARD8Q92502 1023 aa31.4■■■□□ 2.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 CMTM7Q96FZ5 175 aa31.4■■■□□ 2.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 CNDP1Q96KN2 507 aa31.4■■■□□ 2.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRMOQ9BU70 441 aa31.4■■■□□ 2.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 MID1IP1Q9NPA3 183 aa31.4■■■□□ 2.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 SNX6Q9UNH7 406 aa31.4■■■□□ 2.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC88CQ9P219 2028 aa31.4■■■□□ 2.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM120BA0PK00 339 aa31.39■■■□□ 2.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 FFAR3O14843 346 aa31.39■■■□□ 2.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPR42O15529 346 aa31.39■■■□□ 2.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 WT1P19544 449 aaPredicted RBP31.39■■■□□ 2.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC18A1P54219 525 aa31.39■■■□□ 2.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAB8AP61006 207 aa31.39■■■□□ 2.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 IFT88Q13099 833 aa31.39■■■□□ 2.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRIM40Q6P9F5 258 aa31.39■■■□□ 2.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHSY3Q70JA7 882 aa31.39■■■□□ 2.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa31.39■■■□□ 2.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 ELOVL6Q9H5J4 265 aa31.39■■■□□ 2.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP31.39■■■□□ 2.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 TCFL5Q9UL49 500 aa31.39■■■□□ 2.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 EPG5Q9HCE0 2579 aa31.39■■■□□ 2.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 SGK494L7N484 410 aa31.39■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP31.39■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP31.39■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 ERI3O43414 337 aaKnown RBP31.39■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 TGFB1P01137 390 aa31.39■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 DHRS4L1P0CG22 281 aa31.39■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM35AQ53FP2 167 aa31.39■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDYL2Q8N8U2 506 aa31.39■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa31.39■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP31.39■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC29A3Q9BZD2 475 aa31.39■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 WDR54Q9H977 334 aa31.39■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 PSD3Q9NYI0 1048 aa31.39■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 CTSFQ9UBX1 484 aa31.39■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPT2Q9UMR5 302 aa31.39■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAGEB17A8MXT2 336 aa31.38■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 C4orf51C9J302 202 aa31.38■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 ENO1P06733 434 aaKnown RBP31.38■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 NEK2P51955 445 aa31.38■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPS18P62269 152 aaKnown RBP31.38■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 NUDCD3Q8IVD9 361 aa31.38■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNF175Q8N4F7 328 aa31.38■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAR2Q96K12 515 aa31.38■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 F2RL3Q96RI0 385 aa31.38■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRPC4Q9UBN4 977 aa31.38■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP31.38■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 PKD1L2Q7Z442 2459 aa31.38■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa31.37■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A088AWK7 358 aa31.37■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 BIRC5O15392 142 aa31.37■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 NPHS1O60500 1241 aa31.37■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP31.37■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 CREG1O75629 220 aa31.37■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP31.37■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP31.37■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 OCA2Q04671 838 aa31.37■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 TGM3Q08188 693 aa31.37■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 NKG7Q16617 165 aa31.37■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 DEPDC1Q5TB30 811 aa31.37■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP31.37■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 CENPKQ9BS16 269 aa31.37■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACBD3Q9H3P7 528 aa31.37■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP31.37■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 K7ENP7 123 aa31.36■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 RDH16O75452 317 aa31.36■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP31.36■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCR10P46092 362 aa31.36■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLA2G16P53816 162 aa31.36■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPS13P62277 151 aaKnown RBP31.36■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 MC1RQ01726 317 aa31.36■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABHD17CQ6PCB6 329 aa31.36■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP31.36■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANKRD42Q8N9B4 389 aa31.36■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 METTL6Q8TCB7 284 aa31.36■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP31.36■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 KCNC2Q96PR1 638 aa31.36■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 YIPF2Q9BWQ6 316 aa31.36■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR51B5Q9H339 312 aa31.36■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP31.36■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 CPNE5Q9HCH3 593 aa31.36■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF446Q9NWS9 450 aa31.36■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 VSTM2BA6NLU5 285 aa31.35■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP31.35■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 RECKO95980 971 aa31.35■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 B3GALT4O96024 378 aa31.35■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRT6AP02538 564 aa31.35■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRT6BP04259 564 aa31.35■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 HMOX2P30519 316 aa31.35■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRT6CP48668 564 aa31.35■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP31.35■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 VAC14Q08AM6 782 aa31.35■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP31.35■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 TTMPQ5BVD1 217 aa31.35■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa31.35■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR2Y1Q8NGV0 311 aa31.35■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 STT3BQ8TCJ2 826 aa31.35■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP31.35■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF860A6NHJ4 632 aa31.34■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms