RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561726.1

TNRC6A-208, Transcript of trinucleotide repeat containing 6A, humanhuman

TSL 4

Gene TNRC6A, Length 543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6A-208ENST00000561726 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 YWHAQP27348 245 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 GABRA5P31644 462 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 SLC8A1P32418 973 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 OR1D2P34982 312 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 RORAP35398 523 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 LIPAP38571 399 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 MTCP1P56278 107 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 GSCP56915 257 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 RAE1P78406 368 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 DLK1P80370 383 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 CCZ1BP86790 482 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 SORDQ00796 357 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 DMWDQ09019 674 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 MERTKQ12866 999 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 NAE1Q13564 534 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 ENPP2Q13822 863 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 GPR176Q14439 515 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 PARP6Q2NL67 630 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 TBC1D25Q3MII6 688 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 POM121L1PQ3SYA9 428 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 DCAF6Q58WW2 860 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 C6orf10Q5SRN2 563 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 ZNF618Q5T7W0 954 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 MLIPQ5VWP3 458 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 LYSMD4Q5XG99 296 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 SUMO4Q6EEV6 95 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 ASPHD2Q6ICH7 369 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 LRRC8BQ6P9F7 803 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 SLC16A9Q7RTY1 509 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 LUZP2Q86TE4 346 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 VPS36Q86VN1 386 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 FJX1Q86VR8 437 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 ANKRD46Q86W74 232 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 STHQ8IWL8 128 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 LAX1Q8IWV1 398 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 GALNT16Q8N428 558 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 FAM47BQ8NA70 645 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 FNDC5Q8NAU1 212 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 OR13F1Q8NGS4 319 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 ERMNQ8TAM6 284 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 LRRC20Q8TCA0 184 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 GLYATL2Q8WU03 294 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
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TNRC6A-208ENST00000561726 CTHRC1Q96CG8 243 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
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TNRC6A-208ENST00000561726 MYADMQ96S97 322 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 ACBD6Q9BR61 282 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 CHRDL1Q9BU40 450 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 IFT27Q9BW83 186 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 WWP1Q9H0M0 922 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 FBXO44Q9H4M3 255 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 CALHM2Q9HA72 323 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 ZNF160Q9HCG1 818 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 Q9N2J8 555 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 MED4Q9NPJ6 270 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 DPP3Q9NY33 737 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 FLRT1Q9NZU1 646 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 SEMA5BQ9P283 1151 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 ERVK-18Q9QC07 812 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 MBD2Q9UBB5 411 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 COPS7AQ9UBW8 275 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 RNF24Q9Y225 148 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 ZNF510Q9Y2H8 683 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 DISP3Q9P2K9 1392 aa3.25□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 EVC2Q86UK5 1308 aa3.24□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 TRAV25A0A0B4J276 109 aa3.24□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 A0A1W2PPV4 95 aa3.24□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 TMEM247A6NEH6 219 aa3.24□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 ANKUB1A6NFN9 424 aa3.24□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 HSPB2A8KAH6 182 aa3.24□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 KLF11O14901 512 aa3.24□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 SLC22A2O15244 555 aa3.24□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 SPRY2O43597 315 aa3.24□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 PRAMEF2O60811 474 aa3.24□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 PRAF2O60831 178 aa3.24□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 SDC3O75056 442 aa3.24□□□□□ -1.89
TNRC6A-208ENST00000561726 LRP3O75074 770 aa3.24□□□□□ -1.89
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