RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559770.1

MFGE8-211, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 2

Gene MFGE8, Length 680 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-211ENST00000559770 AICDAQ9GZX7 198 aa12.15□□□□□ -0.46
MFGE8-211ENST00000559770 DPH5Q9H2P9 285 aa12.15□□□□□ -0.46
MFGE8-211ENST00000559770 GPAMQ9HCL2 828 aa12.15□□□□□ -0.46
MFGE8-211ENST00000559770 SAYSD1Q9NPB0 183 aa12.15□□□□□ -0.46
MFGE8-211ENST00000559770 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa12.15□□□□□ -0.46
MFGE8-211ENST00000559770 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
MFGE8-211ENST00000559770 DYRK1BQ9Y463 629 aa12.15□□□□□ -0.46
MFGE8-211ENST00000559770 TRAV17A0A0B4J275 112 aa12.14□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa12.14□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 FAM159BA6NKW6 160 aa12.14□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 MAGEB17A8MXT2 336 aa12.14□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 C4orf51C9J302 202 aa12.14□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 CHST10O43529 356 aa12.14□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 FHP07954 510 aa12.14□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 TDGF1P3P51864 188 aa12.14□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 GPX6P59796 221 aa12.14□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 POU4F1Q01851 419 aa12.14□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 RGS1Q08116 209 aa12.14□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 C2orf54Q08AI8 447 aa12.14□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 CALCOCO2Q13137 446 aa12.14□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 BTBD16Q32M84 506 aa12.14□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 DEFB134Q4QY38 66 aa12.14□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 NIPAL1Q6NVV3 410 aa12.14□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 FAM180AQ6UWF9 173 aa12.14□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 CAPN12Q6ZSI9 719 aa12.14□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 MAATS1Q7Z4T9 603 aa12.14□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 MRGPRGQ86SM5 289 aa12.14□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 TMPRSS11BQ86T26 416 aa12.14□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa12.14□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 CDH24Q86UP0 819 aa12.14□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 TRPV3Q8NET8 790 aa12.14□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 M1APQ8TC57 530 aa12.14□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 CREB3L4Q8TEY5 395 aa12.14□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 TSLPQ969D9 159 aa12.14□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 GPR22Q99680 433 aa12.14□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 NPAS2Q99743 824 aa12.14□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 AIF1LQ9BQI0 150 aa12.14□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 RBCK1Q9BYM8 510 aa12.14□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 PHACTR1Q9C0D0 580 aa12.14□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 CAB39LQ9H9S4 337 aa12.14□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 KCNE2Q9Y6J6 123 aa12.14□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 OR5H15A6NDH6 313 aa12.13□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 TAPBPO15533 448 aa12.13□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 F10P00742 488 aa12.13□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 SERPIND1P05546 499 aa12.13□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 GSTA2P09210 222 aa12.13□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 CAPN3P20807 821 aa12.13□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 SSTR2P30874 369 aa12.13□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 GGT5P36269 586 aa12.13□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 GDF5P43026 501 aa12.13□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 SKP1P63208 163 aa12.13□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 OLR1P78380 273 aa12.13□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 USP10Q14694 798 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 ABRAXAS2Q15018 415 aa12.13□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 TGFBIQ15582 683 aa12.13□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 NSDHLQ15738 373 aa12.13□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 EXT1Q16394 746 aa12.13□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 SFT2D3Q587I9 215 aa12.13□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 ABHD17BQ5VST6 288 aa12.13□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa12.13□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 ABHD13Q7L211 337 aa12.13□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 BCORP1Q8N888 145 aa12.13□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 TBC1D20Q96BZ9 403 aa12.13□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 CCDC120Q96HB5 630 aa12.13□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 RBBP8Q99708 897 aa12.13□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 CPNE1Q99829 537 aa12.13□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 EGFL8Q99944 293 aa12.13□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 TMEM79Q9BSE2 394 aa12.13□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 KLHL31Q9H511 634 aa12.13□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 MMP25Q9NPA2 562 aa12.13□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 OLAHQ9NV23 265 aa12.13□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 STMN3Q9NZ72 180 aa12.13□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 PRAMEF4O60810 478 aa12.12□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 WDR47O94967 919 aa12.12□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 SERPINA6P08185 405 aa12.12□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa12.12□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 CD1DP15813 335 aa12.12□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 GNAZP19086 355 aa12.12□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 JAK1P23458 1154 aa12.12□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 GP5P40197 560 aa12.12□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 KCNK10P57789 538 aa12.12□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 RAB8AP61006 207 aa12.12□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 ETF1P62495 437 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 ZNF33BQ06732 778 aa12.12□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 CDKL4Q5MAI5 379 aa12.12□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 ACER2Q5QJU3 275 aa12.12□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa12.12□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 FCRLBQ6BAA4 426 aa12.12□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 ZDHHC24Q6UX98 284 aa12.12□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 QSOX2Q6ZRP7 698 aa12.12□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa12.12□□□□□ -0.47
MFGE8-211ENST00000559770 FRA10AC1Q70Z53 315 aa12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms