RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551936.5

CS-229, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-229	ENST00000551936	WDR47	O94967	919 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	GNAZ	P19086	355 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	POU4F1	Q01851	419 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	TGFBI	Q15582	683 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	SPINK14	Q6IE38	97 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	CYS1	Q717R9	158 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	CA13	Q8N1Q1	262 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	HES7	Q9BYE0	225 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	WHRN	Q9P202	907 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	COPG2	Q9UBF2	871 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	GABRR3	A8MPY1	467 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	CDK2AP1	O14519	115 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	13.57	□□□□□ -0.24	2e-6	■■■■□ 21.8
CS-229	ENST00000551936	RAD51C	O43502	376 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	UNC5C	O95185	931 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	C1QA	P02745	245 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	MAOA	P21397	527 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	GGT5	P36269	586 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	SLC12A2	P55011	1212 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	TAS2R50	P59544	299 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	BTN3A2	P78410	334 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	CALCOCO2	Q13137	446 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	RUNX2	Q13950	521 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	OR1C1	Q15619	314 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	13.57	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	LGI4	Q8N135	537 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	SLC5A8	Q8N695	610 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	RHBG	Q9H310	441 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	NT5DC2	Q9H857	520 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	ASPDH	A6ND91	283 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	SAGE2P	A6NJ88	616 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	FAM159B	A6NKW6	160 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	PRAMEF4	O60810	478 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	NEURL1	O76050	574 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	CCDC166	P0CW27	439 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	CD1D	P15813	335 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	GPX6	P59796	221 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	STXBP1	P61764	594 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	SLC25A25	Q6KCM7	469 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	CYP4X1	Q8N118	509 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	TTL	Q8NG68	377 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	CDKL2	Q92772	493 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	GPR22	Q99680	433 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	RBBP8	Q99708	897 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	CPNE1	Q99829	537 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	KLHL1	Q9NR64	748 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	LRFN1	Q9P244	771 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936		A0A0G2JN53	185 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	LRIT2	A6NDA9	550 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936		A8MUA0	341 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	PSMD12	O00232	456 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	SP1	P08047	785 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	CD46	P15529	392 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-229	ENST00000551936	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24

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