RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549278.1

AC024909.1-201, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene AC024909.1, Length 599 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC024909.1-201ENST00000549278 SPPL2AQ8TCT8 520 aa4.8□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 CXorf40AQ8TE69 158 aa4.8□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 FAR1Q8WVX9 515 aa4.8□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 PROX1Q92786 737 aa4.8□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 YIPF6Q96EC8 236 aa4.8□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 PDXPQ96GD0 296 aa4.8□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 APIPQ96GX9 242 aa4.8□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 HSH2DQ96JZ2 352 aa4.8□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 C7orf34Q96L11 122 aa4.8□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 B3GALT6Q96L58 329 aa4.8□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 SAMD11Q96NU1 681 aa4.8□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 YME1L1Q96TA2 773 aa4.8□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 PIP5K1AQ99755 562 aa4.8□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 COPS4Q9BT78 406 aa4.8□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 CCDC32Q9BV29 185 aa4.8□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 FAIM2Q9BWQ8 316 aa4.8□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa4.8□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 CDCA4Q9BXL8 241 aa4.8□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 SLC46A2Q9BY10 475 aa4.8□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 ROGDIQ9GZN7 287 aa4.8□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 ZBP1Q9H171 429 aa4.8□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 RIBC2Q9H4K1 309 aa4.8□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 ANKRD19PQ9H560 264 aa4.8□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 C3orf14Q9HBI5 128 aa4.8□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 A4GALTQ9NPC4 353 aa4.8□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 MIEF1Q9NQG6 463 aa4.8□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 PRDM8Q9NQV8 689 aa4.8□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 TLR9Q9NR96 1032 aa4.8□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 EXD2Q9NVH0 621 aa4.8□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 KLHL3Q9UH77 587 aa4.8□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa4.8□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 STUB1Q9UNE7 303 aa4.8□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa4.8□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 ASB1Q9Y576 335 aa4.8□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa4.8□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 ACTL7AQ9Y615 435 aa4.8□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 ENPP4Q9Y6X5 453 aa4.8□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 VWA8A3KMH1 1905 aa4.8□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 MYLKQ15746 1914 aa4.8□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 FUOMA2VDF0 154 aa4.79□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 OR2A25A4D2G3 310 aa4.79□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 DUXAA6NLW8 204 aa4.79□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 ZBBXA8MT70 800 aa4.79□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 ARHGEF33A8MVX0 844 aa4.79□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 C9JVG2 144 aa4.79□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 K7ERQ8 282 aa4.79□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 FAAHO00519 579 aa4.79□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 TOR1BO14657 336 aa4.79□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 KMOO15229 486 aa4.79□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 TSPAN6O43657 245 aa4.79□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 AIREO43918 545 aa4.79□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 TNFRSF21O75509 655 aa4.79□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 LEFTY1O75610 366 aa4.79□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 SNAPC5O75971 98 aa4.79□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 FGF18O76093 207 aa4.79□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 SLITRK5O94991 958 aa4.79□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 INMTO95050 263 aa4.79□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 GADD45GO95257 159 aa4.79□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 PRAMEF12O95522 483 aa4.79□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 PTTG1O95997 202 aa4.79□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 FGBP02675 491 aa4.79□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 CDK1P06493 297 aa4.79□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 CLTBP09497 229 aa4.79□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 FURINP09958 794 aa4.79□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 GAAP10253 952 aa4.79□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 ARAFP10398 606 aa4.79□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 LAMP1P11279 417 aa4.79□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 ACADMP11310 421 aa4.79□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 CD36P16671 472 aa4.79□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 NPPBP16860 134 aa4.79□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 SYN1P17600 705 aa4.79□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 RPL17P18621 184 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 CD72P21854 359 aa4.79□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 GALP22466 123 aa4.79□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP4.79□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 PSMB9P28065 219 aa4.79□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 HTR1BP28222 390 aa4.79□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 NDUFS1P28331 727 aa4.79□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 SHMT2P34897 504 aa4.79□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 MMP12P39900 470 aa4.79□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 ETV6P41212 452 aa4.79□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 CRATP43155 626 aa4.79□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 GPR1P46091 355 aa4.79□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 STT3AP46977 705 aa4.79□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 DGKGP49619 791 aa4.79□□□□□ -1.64
AC024909.1-201ENST00000549278 CCR8P51685 355 aa4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms