RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540101.2

C16orf62-211, Transcript of UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

TSL 3

Gene C16orf62, Length 461 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62-211ENST00000540101 C1orf109Q9NX04 203 aa7.44□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 VPS29Q9UBQ0 182 aa7.44□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 DCTN4Q9UJW0 460 aa7.44□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 SLC12A4Q9UP95 1085 aa7.44□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa7.44□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 SLC22A7Q9Y694 548 aa7.44□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 ASXL3Q9C0F0 2248 aa7.44□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 PTPRBP23467 1997 aa7.44□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 ADAMTS20P59510 1910 aa7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 IGSF10Q6WRI0 2623 aa7.43□□□□□ -1.22
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C16orf62-211ENST00000540101 A0A0G2JND7 137 aa7.43□□□□□ -1.22
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C16orf62-211ENST00000540101 GOLGA8OA6NCC3 632 aa7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 ANKDD1BA6NHY2 528 aa7.43□□□□□ -1.22
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C16orf62-211ENST00000540101 GOLGA8NF8WBI6 632 aa7.43□□□□□ -1.22
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C16orf62-211ENST00000540101 ANKRD28O15084 1053 aa7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 RGS14O43566 566 aa7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 FOXS1O43638 330 aa7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 DIAPH2O60879 1101 aa7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 VPS4BO75351 444 aa7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 EEDO75530 441 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 OR2B3O76000 313 aa7.43□□□□□ -1.22
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C16orf62-211ENST00000540101 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 TSFMP43897 325 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 MC2RQ01718 297 aa7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 ACY1Q03154 408 aa7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 EMX2Q04743 252 aa7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 IL11RAQ14626 422 aa7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 NR6A1Q15406 480 aa7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 AP5B1Q2VPB7 878 aa7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 TCTE1Q5JU00 501 aa7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 TMTC4Q5T4D3 741 aa7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 GARNL3Q5VVW2 1013 aa7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 TMEM198Q66K66 360 aa7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 PRSS41Q7RTY9 318 aa7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 COMMD6Q7Z4G1 85 aa7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 TMPRSS12Q86WS5 348 aa7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 SHISA5Q8N114 240 aa7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 GALNT15Q8N3T1 639 aa7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 DTWD1Q8N5C7 304 aa7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 AMER3Q8N944 861 aa7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 SLC38A9Q8NBW4 561 aa7.43□□□□□ -1.22
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C16orf62-211ENST00000540101 GAL3ST3Q96A11 431 aa7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
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C16orf62-211ENST00000540101 CRELD1Q96HD1 420 aa7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 PPP1R36Q96LQ0 422 aa7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 PPP3R2Q96LZ3 170 aa7.43□□□□□ -1.22
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C16orf62-211ENST00000540101 OR6C1Q96RD1 312 aa7.43□□□□□ -1.22
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C16orf62-211ENST00000540101 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 FAM107BQ9H098 131 aa7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 RABEP2Q9H5N1 569 aa7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 LRTM1Q9HBL6 345 aa7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 APMAPQ9HDC9 416 aa7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 TCF7L2Q9NQB0 619 aa7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 FBXO8Q9NRD0 319 aa7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 STARD5Q9NSY2 213 aa7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 RIC8BQ9NVN3 520 aa7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 DKK4Q9UBT3 224 aa7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 ADAM29Q9UKF5 820 aa7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 CLCA2Q9UQC9 943 aa7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 LOXL2Q9Y4K0 774 aa7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 HYKKA2RU49 373 aa7.42□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 EFCAB7A8K855 629 aa7.42□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa7.42□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 TXNDC9O14530 226 aa7.42□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 ZNF749O43361 778 aa7.42□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 ERI3O43414 337 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 TMPRSS11DO60235 418 aa7.42□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 DNAJB6O75190 326 aa7.42□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 PEX11AO75192 247 aa7.42□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 SH3BGRLO75368 114 aa7.42□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 ONECUT2O95948 504 aa7.42□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 B3GALT4O96024 378 aa7.42□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 BCKDHAP12694 445 aa7.42□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 ALOX12P18054 663 aa7.42□□□□□ -1.22
C16orf62-211ENST00000540101 LBPP18428 481 aa7.42□□□□□ -1.22
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