RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533362.1

PUF60-222, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, human

TSL 5

Gene PUF60, Length 616 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUF60-222	ENST00000533362	VPS50	Q96JG6	964 aa		21.28	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	KCNC2	Q96PR1	638 aa		21.28	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	CDK15	Q96Q40	435 aa		21.28	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	TRMO	Q9BU70	441 aa		21.28	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	MS4A8	Q9BY19	250 aa		21.28	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		21.28	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		21.28	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	21.28	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	ELOVL6	Q9H5J4	265 aa		21.28	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	21.28	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		21.28	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		21.28	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	CTSF	Q9UBX1	484 aa		21.28	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	PPT2	Q9UMR5	302 aa		21.28	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	VSTM2B	A6NLU5	285 aa		21.27	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	SGK494	L7N484	410 aa		21.27	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	21.27	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	21.27	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	ZWINT	O95229	277 aa		21.27	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	21.27	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	CYC1	P08574	325 aa		21.27	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		21.27	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	ARFIP1	P53367	373 aa		21.27	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	NAGLU	P54802	743 aa		21.27	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	RAB8A	P61006	207 aa		21.27	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	21.27	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	SSPN	Q14714	243 aa		21.27	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	FRG2	Q64ET8	278 aa		21.27	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		21.27	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		21.27	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		21.27	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		21.27	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		21.27	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	SMIM10	Q96HG1	83 aa		21.27	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	FRG2B	Q96QU4	278 aa		21.27	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		21.27	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		21.27	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		21.27	■■□□□ 1
PUF60-222	ENST00000533362	CDC14C	A4D256	554 aa		21.26	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	PCDH17	O14917	1159 aa		21.26	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	NKX2-8	O15522	239 aa		21.26	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	RDH16	O75452	317 aa		21.26	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	KRT6A	P02538	564 aa		21.26	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	KRT6B	P04259	564 aa		21.26	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		21.26	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	PRKAR1A	P10644	381 aa		21.26	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	21.26	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	21.26	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	21.26	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	KRT6C	P48668	564 aa		21.26	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	RAP1GDS1	P52306	607 aa		21.26	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	21.26	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	ERV3-1	Q14264	604 aa		21.26	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	KHDRBS2	Q5VWX1	349 aa	Known RBP	21.26	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	21.26	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	PRSS41	Q7RTY9	318 aa		21.26	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	PDSS2	Q86YH6	399 aa		21.26	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		21.26	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		21.26	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	OR1F2P	Q96R84	312 aa		21.26	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	SPSB2	Q99619	263 aa		21.26	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		21.26	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	21.26	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	KLHL31	Q9H511	634 aa		21.26	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		21.26	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		21.26	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	POLH	Q9Y253	713 aa		21.26	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	B3GALT2	O43825	422 aa		21.25	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	ESRRB	O95718	433 aa		21.25	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	ITGB2	P05107	769 aa		21.25	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	CREB1	P16220	341 aa		21.25	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	TSPAN8	P19075	237 aa		21.25	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	HMOX2	P30519	316 aa		21.25	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	SERPINB5	P36952	375 aa		21.25	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	BTN3A2	P78410	334 aa		21.25	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	RHD	Q02161	417 aa		21.25	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	ZNF33B	Q06732	778 aa		21.25	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	CUL3	Q13618	768 aa		21.25	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	RCN2	Q14257	317 aa		21.25	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		21.25	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		21.25	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		21.25	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		21.25	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	CNDP1	Q96KN2	507 aa		21.25	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	SERINC2	Q96SA4	455 aa		21.25	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	21.25	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	SERPINI1	Q99574	410 aa		21.25	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	CRB3	Q9BUF7	120 aa		21.25	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		21.25	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		21.25	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	PSMD12	O00232	456 aa	Predicted RBP	21.24	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	FFAR3	O14843	346 aa		21.24	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	GPR42	O15529	346 aa		21.24	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	21.24	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	CRCP	O75575	148 aa		21.24	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	OR4F21	O95013	312 aa		21.24	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	TGFB1	P01137	390 aa		21.24	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	JAK1	P23458	1154 aa		21.24	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	ALDH3A1	P30838	453 aa		21.24	■□□□□ 0.99
PUF60-222	ENST00000533362	XCR1	P46094	333 aa		21.24	■□□□□ 0.99

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