RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532181.5

SSH3-208, Transcript of slingshot protein phosphatase 3, human

TSL 3

Gene SSH3, Length 948 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSH3-208	ENST00000532181	FKBP10	Q96AY3	582 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SSH3-208	ENST00000532181	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SSH3-208	ENST00000532181	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SSH3-208	ENST00000532181	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SSH3-208	ENST00000532181	MS4A8	Q9BY19	250 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SSH3-208	ENST00000532181	EPN3	Q9H201	632 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SSH3-208	ENST00000532181	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SSH3-208	ENST00000532181	CLMP	Q9H6B4	373 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SSH3-208	ENST00000532181	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SSH3-208	ENST00000532181	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SSH3-208	ENST00000532181	POLH	Q9Y253	713 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SSH3-208	ENST00000532181	PLLP	Q9Y342	182 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SSH3-208	ENST00000532181		C9J4A7	227 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	TXNDC9	O14530	226 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	CHST10	O43529	356 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	TYROBP	O43914	113 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	GLRA3	O75311	464 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	ALOX12B	O75342	701 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	CLEC3A	O75596	197 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	BMP10	O95393	424 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	TGFB1	P01137	390 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	ALB	P02768	609 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	SLC35G6	P0C7Q6	338 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	ALOX12	P18054	663 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	IMPDH1	P20839	514 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	OTX2	P32243	289 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	HERVK_113	P63132	956 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	ATP1A4	Q13733	1029 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	IGFBP7	Q16270	282 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	KRT71	Q3SY84	523 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	LCA5	Q86VQ0	697 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	KRT78	Q8N1N4	520 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	TRPV3	Q8NET8	790 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	OR4F6	Q8NGB9	312 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	MVB12A	Q96EY5	273 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	NTMT1	Q9BV86	223 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	OR51B5	Q9H339	312 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	LANCL2	Q9NS86	450 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	MKS1	Q9NXB0	559 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	CCDC151	A5D8V7	595 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181		H0YIG0	161 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	AGPS	O00116	658 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	SOCS6	O14544	535 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	COPE	O14579	308 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	OR4F21	O95013	312 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	PDGFA	P04085	211 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	TUBB	P07437	444 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	PCNA	P12004	261 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	CPA3	P15088	417 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	CHN1	P15882	459 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	CXCR2	P25025	360 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	ARRB2	P32121	409 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	HNRNPF	P52597	415 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	PLA2G16	P53816	162 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	BTN3A2	P78410	334 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	CLC	Q05315	142 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181		Q0VFX4	171 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	SSPN	Q14714	243 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	PCLAF	Q15004	111 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	NDUFA9	Q16795	377 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	LIPJ	Q5W064	366 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	MED27	Q6P2C8	311 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	CCT6B	Q92526	530 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	C8orf44	Q96CB5	159 aa		11.63	□□□□□ -0.55

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