RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531908.5

RPS13-208, Transcript of ribosomal protein S13, human

TSL 2

Gene RPS13, Length 746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS13-208	ENST00000531908	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS13-208	ENST00000531908	SYT11	Q9BT88	431 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS13-208	ENST00000531908	ABHD6	Q9BV23	337 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS13-208	ENST00000531908	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS13-208	ENST00000531908	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS13-208	ENST00000531908	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS13-208	ENST00000531908	TFR2	Q9UP52	801 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS13-208	ENST00000531908	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPS13-208	ENST00000531908	SCN4A	P35499	1836 aa		4.65	□□□□□ -1.66
RPS13-208	ENST00000531908	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF233	A6NK53	670 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	ADAM20	O43506	726 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	ADRB2	P07550	413 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	FER	P16591	822 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	GPC3	P51654	580 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	EMC2	Q15006	297 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	TAF13	Q15543	124 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	EPC2	Q52LR7	807 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	LINGO4	Q6UY18	593 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	KRT74	Q7RTS7	529 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	KIAA1328	Q86T90	577 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	OR2T12	Q8NG77	320 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	SPATA33	Q96N06	139 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	DUX3	Q96PT4	197 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	MYADM	Q96S97	322 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	CARD6	Q9BX69	1037 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	GPR88	Q9GZN0	384 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	AZI2	Q9H6S1	392 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	RHCG	Q9UBD6	479 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	PTPRF	P10586	1907 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908		A0A0G2JMZ2	1700 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	WDR90	Q96KV7	1748 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	MYH11	P35749	1972 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	HYKK	A2RU49	373 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	DUXA	A6NLW8	204 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	OR6C76	A6NM76	312 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908		F8VZ95	297 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	EXTL3	O43909	919 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	SP1	P08047	785 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	LINGO3	P0C6S8	592 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	OR2T7	P0C7T2	308 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	CCDC172	P0C7W6	258 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	TRIM49	P0CI25	452 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	TRIM49C	P0CI26	452 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	MT3	P25713	68 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	KRT20	P35900	424 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	MTHFR	P42898	656 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	GCLM	P48507	274 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	THOP1	P52888	689 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	PDX1	P52945	283 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	CDH13	P55290	713 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	KCNJ10	P78508	379 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	MYL7	Q01449	175 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	ARHGAP1	Q07960	439 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	CYP24A1	Q07973	514 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	CETN1	Q12798	172 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	DRP2	Q13474	957 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	GRB14	Q14449	540 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	PSMD6	Q15008	389 aa		4.64	□□□□□ -1.67

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