RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520898.5

UBR5-208, Transcript of ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 5, human

TSL 3

Gene UBR5, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBR5-208	ENST00000520898	UGT1A9	O60656	530 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	ALOX12B	O75342	701 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	OR2B3	O76000	313 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	TSPAN15	O95858	294 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	EPO	P01588	193 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	TPM2	P07951	284 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	UGT1A6	P19224	532 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	ITGAX	P20702	1163 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	AGA	P20933	346 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	UGT1A1	P22309	533 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	UGT1A4	P22310	534 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	SPAM1	P38567	509 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	CA7	P43166	264 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	SLURP1	P55000	103 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	UCP3	P55916	312 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	KCNK10	P57789	538 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	GTF3C1	Q12789	2109 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	MFAP5	Q13361	173 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	KRT81	Q14533	505 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	PDK2	Q15119	407 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	ZIC1	Q15915	447 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	INA	Q16352	499 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	NKAIN1	Q4KMZ8	207 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	BCL7A	Q4VC05	210 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	VWA2	Q5GFL6	755 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	C1orf189	Q5VU69	101 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	MTFR2	Q6P444	385 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	XKRX	Q6PP77	449 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	LCN9	Q8WX39	176 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	NR4A3	Q92570	626 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	MUL1	Q969V5	352 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	FKBP10	Q96AY3	582 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	LRRC46	Q96FV0	321 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	CNDP1	Q96KN2	507 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	LMF1	Q96S06	567 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	LHPP	Q9H008	270 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	TRABD	Q9H4I3	376 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	WDR54	Q9H977	334 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	IL17C	Q9P0M4	197 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	XPR1	Q9UBH6	696 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	DHCR7	Q9UBM7	475 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	HEBP2	Q9Y5Z4	205 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	ABCA4	P78363	2273 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	ZAN	Q9Y493	2812 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	AGAP14	A8MT82	685 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	C2orf74	A8MZ97	194 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	DIAPH2	O60879	1101 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	HSD3B1	P14060	373 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	MSH3	P20585	1137 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	MST1	P26927	711 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	PBX1	P40424	430 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	CD151	P48509	253 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	PRLHR	P49683	370 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	TNFSF10	P50591	281 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	TAS2R40	P59535	323 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	ITGA9	Q13797	1035 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	CDSN	Q15517	529 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	ASIC2	Q16515	512 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	PFKFB4	Q16877	469 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	SPESP1	Q6UW49	350 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	KDELC1	Q6UW63	502 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	COX15	Q7KZN9	410 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBR5-208	ENST00000520898	DET1	Q7L5Y6	550 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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