RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520578.5

G3BP1-209, Transcript of G3BP stress granule assembly factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene G3BP1, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1-209ENST00000520578 NSL1Q96IY1 281 aa14.66□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 TSSK3Q96PN8 268 aa14.66□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 DPYSL5Q9BPU6 564 aa14.66□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 PDE7BQ9NP56 450 aa14.66□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 AHSPQ9NZD4 102 aa14.66□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 CCDC167Q9P0B6 97 aa14.66□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 TAGLN3Q9UI15 199 aa14.66□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 ADAM29Q9UKF5 820 aa14.66□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 PLCL2Q9UPR0 1127 aa14.66□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 DMDP11532 3685 aa14.66□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 PCNX2A6NKB5 2137 aa14.66□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 CROCCQ5TZA2 2017 aa14.65□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 A0A0G2JN53 185 aa14.65□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa14.65□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 FAM234BA2RU67 622 aa14.65□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 C4orf47A7E2U8 309 aa14.65□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 C9JVG2 144 aa14.65□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 TMPRSS11DO60235 418 aa14.65□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 SLC22A3O75751 556 aa14.65□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 RASSF9O75901 435 aa14.65□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 MYO1DO94832 1006 aa14.65□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 UNC5CO95185 931 aa14.65□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 GBAP04062 536 aa14.65□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 KLK1P06870 262 aa14.65□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 SLC35G6P0C7Q6 338 aa14.65□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 NELFEP18615 380 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 CAPN3P20807 821 aa14.65□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 RAP1GDS1P52306 607 aa14.65□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 PLA2G16P53816 162 aa14.65□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 HSD11B2P80365 405 aa14.65□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 ZNF763Q0D2J5 394 aa14.65□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 RCAN2Q14206 197 aa14.65□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 OR4C11Q6IEV9 310 aa14.65□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 NUDT13Q86X67 352 aa14.65□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa14.65□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 C16orf78Q8WTQ4 265 aa14.65□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 C17orf62Q9BQA9 187 aa14.65□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 TBCDQ9BTW9 1192 aa14.65□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 CLMPQ9H6B4 373 aa14.65□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 MYNNQ9NPC7 610 aa14.65□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 SOHLH2Q9NX45 425 aa14.65□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 MYO15AQ9UKN7 3530 aa14.65□□□□□ -0.06
G3BP1-209ENST00000520578 ASPDHA6ND91 283 aa14.64□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 A8MU76 341 aa14.64□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 D6RAR5 112 aa14.64□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 FBP2O00757 339 aa14.64□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 GDF9O60383 454 aa14.64□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 PRMT3O60678 531 aa14.64□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 MED26O95402 600 aa14.64□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 B3GALT4O96024 378 aa14.64□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 CALB2P22676 271 aa14.64□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 TSFMP43897 325 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 GCGRP47871 477 aa14.64□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 SEPHS1P49903 392 aa14.64□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 NCALDP61601 193 aa14.64□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 KCNAB1Q14722 419 aa14.64□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 SNAP47Q5SQN1 464 aa14.64□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 WASHC2DQ5SRD0 308 aa14.64□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 FAM71E1Q6IPT2 247 aa14.64□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 TRIM40Q6P9F5 258 aa14.64□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 PAGE2Q7Z2X7 111 aa14.64□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 PIP4P1Q86T03 277 aa14.64□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 FAM9CQ8IZT9 166 aa14.64□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 TSPEARQ8WU66 669 aa14.64□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 KCNC2Q96PR1 638 aa14.64□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 CENPKQ9BS16 269 aa14.64□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 ZMYND15Q9H091 742 aa14.64□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 PRM3Q9NNZ6 103 aa14.64□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 FER1L5A0AVI2 2057 aa14.63□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 LOC100653049A0A140TA62 436 aa14.63□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 FITM1A5D6W6 292 aa14.63□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 NR5A2O00482 541 aa14.63□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 KRT34O76011 436 aa14.63□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 FOLR1P15328 257 aa14.63□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 SSR2P43308 183 aa14.63□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 ASMTP46597 345 aa14.63□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 CPA2P48052 419 aa14.63□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 PDX1P52945 283 aa14.63□□□□□ -0.07
G3BP1-209ENST00000520578 RAB8AP61006 207 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms