RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 SPATA22Q8NHS9 363 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 MSLNLQ96KJ4 702 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 MRGPRX2Q96LB1 330 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 RAB23Q9ULC3 237 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 ALG5Q9Y673 324 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF487B1APH4 448 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 KAT7O95251 611 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 IGSF6O95976 241 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 PTHP01270 115 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 ALAS2P22557 587 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 RENBPP51606 427 aa9.72□□□□□ -0.85
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TRPS1-211ENST00000520276 FBXO43Q4G163 708 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF680Q8NEM1 530 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 OR52H1Q8NGJ2 320 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 CCDC126Q96EE4 140 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 FSD1LQ9BXM9 530 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 SRRQ9GZT4 340 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 SLC22A4Q9H015 551 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 NIPAL2Q9H841 368 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 FZD10Q9ULW2 581 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 ALPK3Q96L96 1907 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 PRR23AA6NEV1 266 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 FAM170BA6NMN3 283 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 DFNA5O60443 496 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 FCER2P06734 321 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 PER3P56645 1201 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 RIN1Q13671 783 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 TEX261Q6UWH6 196 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF675Q8TD23 568 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 MAGEH1Q9H213 219 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 S1PR5Q9H228 398 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 SMURF1Q9HCE7 757 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 VAPAQ9P0L0 249 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 GMEB2Q9UKD1 530 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 U3KQ87 197 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 GSTA4O15217 222 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 CD72P21854 359 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 KELP23276 732 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 SOX6P35712 828 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 RGS6P49758 472 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF366Q8N895 744 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 CDYL2Q8N8U2 506 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 OR2T12Q8NG77 320 aa9.72□□□□□ -0.85
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TRPS1-211ENST00000520276 KLHL15Q96M94 604 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 KLHL21Q9UJP4 597 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 H3BM21 787 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 STX7O15400 261 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 PMPCBO75439 489 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 VIPP01282 170 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 DRD1P21728 446 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 NPY2RP49146 381 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 HERVK_113P63132 956 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 DMC1Q14565 340 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 GPR19Q15760 415 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 EOGTQ5NDL2 527 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 VITQ6UXI7 678 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 ISCA2Q86U28 154 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 LURAP1LQ8IV03 231 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 FNDC5Q8NAU1 212 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 TSTD1Q8NFU3 115 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 ERVK-6Q9BXR3 956 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 AIG1Q9NVV5 245 aa9.72□□□□□ -0.85
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TRPS1-211ENST00000520276 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 FAM72CH0Y354 149 aa9.71□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 PLA2G10O15496 165 aa9.71□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 JCHAINP01591 159 aa9.71□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 CHMP24386 653 aa9.71□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 UGP2Q16851 508 aa9.71□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 PFKFB4Q16877 469 aa9.71□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 PCID2Q5JVF3 399 aa9.71□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 FAM72AQ5TYM5 149 aa9.71□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 FAM46CQ5VWP2 391 aa9.71□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 KANK2Q63ZY3 851 aa9.71□□□□□ -0.85
TRPS1-211ENST00000520276 CPZQ66K79 652 aa9.71□□□□□ -0.85
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