RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519057.5

COPS5-208, Transcript of COP9 signalosome subunit 5, human

TSL 4

Gene COPS5, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS5-208	ENST00000519057	TRIM77	I1YAP6	450 aa		3.36	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	CCL24	O00175	119 aa		3.36	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	GPRIN2	O60269	458 aa		3.36	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	HMMR	O75330	724 aa		3.36	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	FAM200B	P0CF97	657 aa		3.36	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	MYOG	P15173	224 aa		3.36	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	LHX1	P48742	406 aa		3.36	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF75D	P51815	510 aa		3.36	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	CUL3	Q13618	768 aa		3.36	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	WTAP	Q15007	396 aa		3.36	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		3.36	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	EIPR1	Q53HC9	387 aa		3.36	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		3.36	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		3.36	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	FCRLA	Q7L513	359 aa		3.36	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	IQUB	Q8NA54	791 aa		3.36	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		3.36	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	TEKT1	Q969V4	418 aa		3.36	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	PTER	Q96BW5	349 aa		3.36	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	EVI5L	Q96CN4	794 aa		3.36	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		3.36	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		3.36	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	OLAH	Q9NV23	265 aa		3.36	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		3.36	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		3.36	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	SUN2	Q9UH99	717 aa		3.36	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		3.36	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	SHPRH	Q149N8	1683 aa		3.36	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		3.36	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	DLC1	Q96QB1	1528 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	SH3BP5	O60239	455 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	ERLIN1	O75477	346 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	PGM3	O95394	542 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	BAG3	O95817	575 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	PPP2R1A	P30153	589 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	COPB2	P35606	906 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	DHODH	Q02127	395 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	IFT88	Q13099	833 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	SGCG	Q13326	291 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	SNX21	Q969T3	373 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	MOB3A	Q96BX8	217 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	CALML4	Q96GE6	196 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	PRAM1	Q96QH2	718 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	TRIM7	Q9C029	511 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	TSPY26P	Q9H489	355 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	NLRP1	Q9C000	1473 aa		3.35	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	CPS1	P31327	1500 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	SURF4	O15260	269 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	ATP8B1	O43520	1251 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	MBD3	O95983	291 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	VDR	P11473	427 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	ALOX12	P18054	663 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	CYP11B2	P19099	503 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	CD22	P20273	847 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	ACTN2	P35609	894 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	LMAN1	P49257	510 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	PRELP	P51888	382 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	DCDC1	P59894	354 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	NPTX1	Q15818	432 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	C16orf87	Q6PH81	154 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	CCDC80	Q76M96	950 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	TAGAP	Q8N103	731 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	TCP11	Q8WWU5	503 aa		3.34	□□□□□ -1.87
COPS5-208	ENST00000519057	EXOC4	Q96A65	974 aa		3.34	□□□□□ -1.87

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