RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515170.5

RAPGEF6-214, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

TSL 2

Gene RAPGEF6, Length 4,103 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6-214ENST00000515170 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 NDC1Q9BTX1 674 aa9.51□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 TMED5Q9Y3A6 229 aa9.51□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 PRSS38A1L453 326 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 PSMD11O00231 422 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 E2F3O00716 465 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 SLC16A5O15375 505 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 AHCYL1O43865 530 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 GADD45GO95257 159 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 NR2F6P10588 404 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 ETFAP13804 333 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 CD247P20963 164 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 XKP51811 444 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 IST1P53990 364 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 MS4A2Q01362 244 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 MADCAM1Q13477 382 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 C1DQ13901 141 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 GPR107Q5VW38 600 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 TTLL10Q6ZVT0 673 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 GATSQ8NAP1 163 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 DDHD1Q8NEL9 900 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 GRHL3Q8TE85 626 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 PATE1Q8WXA2 126 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 TMBIM1Q969X1 311 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 FBXL8Q96CD0 374 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 PDXPQ96GD0 296 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 LGR4Q9BXB1 951 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 KLHL1Q9NR64 748 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 SPATA7Q9P0W8 599 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 TRBC2A0A5B9 178 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 ANTXRLA6NF34 631 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 SLC25A12O75746 678 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 C1orf105O95561 183 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 B3GALT4O96024 378 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 SERPINB10P48595 397 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 PRLHRP49683 370 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 RHDQ02161 417 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 KCNC3Q14003 757 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 NCF4Q15080 339 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 DCST1Q5T197 706 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 C1orf53Q5VUE5 145 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 ASPGQ86U10 573 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 OR52L1Q8NGH7 329 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 TADA1Q96BN2 335 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 PRRG3Q9BZD7 231 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 KCNH6Q9H252 994 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 SMURF2Q9HAU4 748 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 APC2O95996 2303 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 MYL12BO14950 172 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 NME6O75414 186 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 HIST1H2ABP04908 130 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 MYL12AP19105 171 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 ACADVLP49748 655 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 CRISP3P54108 245 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 NKX3-2P78367 333 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 MED22Q15528 200 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 FIGLAQ6QHK4 219 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 AHSA2Q719I0 299 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 MAVSQ7Z434 540 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 PDZD3Q86UT5 571 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 HIST1H2ACQ93077 130 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 ADI1Q9BV57 179 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 EHD1Q9H4M9 534 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 MVB12BQ9H7P6 319 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 FGF22Q9HCT0 170 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 NME4O00746 187 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 BCKDKO14874 412 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 OR12D1P0DN82 309 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 BMP1P13497 986 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 CDH15P55291 814 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 MESP2Q0VG99 397 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.891e-6■■■■□ 19.4
RAPGEF6-214ENST00000515170 NEK5Q6P3R8 708 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 TMEM107Q6UX40 140 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 PEX5LQ8IYB4 626 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 CSNK1A1LQ8N752 337 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 OR2L2Q8NH16 312 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 SMPDL3BQ92485 455 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 HSH2DQ96JZ2 352 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 PTCHD1Q96NR3 888 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 IL4I1Q96RQ9 567 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 C1orf21Q9H246 121 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 ACTR3BQ9P1U1 418 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 DKK3Q9UBP4 350 aa9.5□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 C2CD4DB7Z1M9 353 aa9.49□□□□□ -0.89
RAPGEF6-214ENST00000515170 SOX14O95416 240 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms