RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495423.1

SIMC1-208, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIMC1, Length 913 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-208ENST00000495423 GPR21Q99679 349 aa21.78■■□□□ 1.08
SIMC1-208ENST00000495423 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
SIMC1-208ENST00000495423 TAC3Q9UHF0 121 aa21.78■■□□□ 1.08
SIMC1-208ENST00000495423 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa21.77■■□□□ 1.08
SIMC1-208ENST00000495423 H0YIG0 161 aa21.77■■□□□ 1.08
SIMC1-208ENST00000495423 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
SIMC1-208ENST00000495423 INHBAP08476 426 aa21.77■■□□□ 1.08
SIMC1-208ENST00000495423 MPC1LP0DKB6 136 aa21.77■■□□□ 1.08
SIMC1-208ENST00000495423 HSD17B2P37059 387 aa21.77■■□□□ 1.08
SIMC1-208ENST00000495423 AVPR1BP47901 424 aa21.77■■□□□ 1.08
SIMC1-208ENST00000495423 SLC29A2Q14542 456 aa21.77■■□□□ 1.08
SIMC1-208ENST00000495423 RASA2Q15283 850 aa21.77■■□□□ 1.08
SIMC1-208ENST00000495423 NDUFA9Q16795 377 aa21.77■■□□□ 1.08
SIMC1-208ENST00000495423 MEP1AQ16819 746 aa21.77■■□□□ 1.08
SIMC1-208ENST00000495423 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
SIMC1-208ENST00000495423 FCRLBQ6BAA4 426 aa21.77■■□□□ 1.08
SIMC1-208ENST00000495423 SIAH3Q8IW03 269 aa21.77■■□□□ 1.08
SIMC1-208ENST00000495423 GPATCH11Q8N954 259 aa21.77■■□□□ 1.08
SIMC1-208ENST00000495423 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
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SIMC1-208ENST00000495423 EPB41L4BQ9H329 900 aa21.77■■□□□ 1.08
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SIMC1-208ENST00000495423 SLC12A2P55011 1212 aa21.76■■□□□ 1.07
SIMC1-208ENST00000495423 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
SIMC1-208ENST00000495423 ABATP80404 500 aa21.76■■□□□ 1.07
SIMC1-208ENST00000495423 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP21.76■■□□□ 1.07
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SIMC1-208ENST00000495423 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
SIMC1-208ENST00000495423 OR1C1Q15619 314 aa21.76■■□□□ 1.07
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SIMC1-208ENST00000495423 CRLF3Q8IUI8 442 aa21.76■■□□□ 1.07
SIMC1-208ENST00000495423 TMEM178AQ8NBL3 297 aa21.76■■□□□ 1.07
SIMC1-208ENST00000495423 NDNQ99608 321 aa21.76■■□□□ 1.07
SIMC1-208ENST00000495423 NPAS2Q99743 824 aa21.76■■□□□ 1.07
SIMC1-208ENST00000495423 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
SIMC1-208ENST00000495423 KCNK13Q9HB14 408 aa21.76■■□□□ 1.07
SIMC1-208ENST00000495423 KLHL1Q9NR64 748 aa21.76■■□□□ 1.07
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SIMC1-208ENST00000495423 CCDC151A5D8V7 595 aa21.75■■□□□ 1.07
SIMC1-208ENST00000495423 ZNF839A8K0R7 811 aa21.75■■□□□ 1.07
SIMC1-208ENST00000495423 NPIPA5E9PKD4 350 aa21.75■■□□□ 1.07
SIMC1-208ENST00000495423 ERLIN1O75477 346 aa21.75■■□□□ 1.07
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SIMC1-208ENST00000495423 CD46P15529 392 aa21.75■■□□□ 1.07
SIMC1-208ENST00000495423 MSH2P43246 934 aa21.75■■□□□ 1.07
SIMC1-208ENST00000495423 PNLIPRP1P54315 467 aa21.75■■□□□ 1.07
SIMC1-208ENST00000495423 CDKN2DP55273 166 aa21.75■■□□□ 1.07
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SIMC1-208ENST00000495423 MINDY4Q4G0A6 757 aa21.74■■□□□ 1.07
SIMC1-208ENST00000495423 SPINK14Q6IE38 97 aa21.74■■□□□ 1.07
SIMC1-208ENST00000495423 ANKRD37Q7Z713 158 aa21.74■■□□□ 1.07
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SIMC1-208ENST00000495423 ZNF480Q8WV37 535 aa21.74■■□□□ 1.07
SIMC1-208ENST00000495423 DMRTA2Q96SC8 542 aa21.74■■□□□ 1.07
SIMC1-208ENST00000495423 VKORC1Q9BQB6 163 aa21.74■■□□□ 1.07
SIMC1-208ENST00000495423 MMP25Q9NPA2 562 aa21.74■■□□□ 1.07
SIMC1-208ENST00000495423 ANKRD10Q9NXR5 420 aa21.74■■□□□ 1.07
SIMC1-208ENST00000495423 CCDC189A1A4V9 331 aa21.73■■□□□ 1.07
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SIMC1-208ENST00000495423 STMN1P16949 149 aa21.73■■□□□ 1.07
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SIMC1-208ENST00000495423 USP10Q14694 798 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
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SIMC1-208ENST00000495423 TDRPQ86YL5 185 aa21.73■■□□□ 1.07
SIMC1-208ENST00000495423 DOLPP1Q86YN1 238 aa21.73■■□□□ 1.07
SIMC1-208ENST00000495423 LGI4Q8N135 537 aa21.73■■□□□ 1.07
SIMC1-208ENST00000495423 GHDCQ8N2G8 530 aa21.73■■□□□ 1.07
SIMC1-208ENST00000495423 OR51Q1Q8NH59 317 aa21.73■■□□□ 1.07
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