RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489713.5

TMTC4-210, Transcript of transmembrane and tetratricopeptide repeat containing 4, human

TSL 2

Gene TMTC4, Length 2,733 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMTC4-210	ENST00000489713	BMF	Q96LC9	184 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	RHCG	Q9UBD6	479 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	DYTN	A2CJ06	578 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	UGDH	O60701	494 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	CLPTM1	O96005	669 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	GABRG2	P18507	467 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	HPCAL1	P37235	193 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	PIGA	P37287	484 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	GZMM	P51124	257 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	VLDLR	P98155	873 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	ENPP2	Q13822	863 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	LRRC32	Q14392	662 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	ATP6AP1	Q15904	470 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	SPIN4	Q56A73	249 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	CEP68	Q76N32	757 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	MUS81	Q96NY9	551 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	ETAA1	Q9NY74	926 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	ICK	Q9UPZ9	632 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	ZNF860	A6NHJ4	632 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713		G3V2T6	193 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	NDUFS4	O43181	175 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	PRSS23	O95084	383 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	IL7R	P16871	459 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	BCL6	P41182	706 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	PPP1CA	P62136	330 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	OLR1	P78380	273 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	RPE65	Q16518	533 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	NADK2	Q4G0N4	442 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	OR2A1	Q8NGT9	310 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	BDH2	Q9BUT1	245 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	AICDA	Q9GZX7	198 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	REEP4	Q9H6H4	257 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	OLAH	Q9NV23	265 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	ASIC5	Q9NY37	505 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	GSAP	A4D1B5	854 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	DNAJB6	O75190	326 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	FURIN	P09958	794 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	TNFRSF4	P43489	277 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	CCR8	P51685	355 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	CSNK1G2	P78368	415 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	VMAC	Q2NL98	169 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	MTSS1L	Q765P7	747 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713		Q7L0L9	218 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	KRT78	Q8N1N4	520 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	PARP8	Q8N3A8	854 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	KCT2	Q8NC54	265 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	OR13H1	Q8NG92	308 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	NFKBID	Q8NI38	313 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	SMPDL3A	Q92484	453 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	FAM3C	Q92520	227 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	TFAP2C	Q92754	450 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	AIF1L	Q9BQI0	150 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	GPR174	Q9BXC1	333 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	STARD5	Q9NSY2	213 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713		A0A1W2PRB8	838 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713		J3KTA2	159 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	ERI3	O43414	337 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	MAN1A2	O60476	641 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	NPPA	P01160	153 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	TFAP2A	P05549	437 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	EPHA2	P29317	976 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	SSR2	P43308	183 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	CRYBA2	P53672	197 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	MTAP	Q13126	283 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	TP53BP2	Q13625	1128 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMTC4-210	ENST00000489713	RGN	Q15493	299 aa		11.11	□□□□□ -0.63

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