RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484101.5

UFD1-208, Transcript of ubiquitin recognition factor in ER associated degradation 1, human

TSL 5

Gene UFD1, Length 751 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UFD1-208	ENST00000484101		A0A1W2PPV9	198 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	GABRR3	A8MPY1	467 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	NDUFS4	O43181	175 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	IFNA14	P01570	189 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	LAMP1	P11279	417 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	DRD2	P14416	443 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	ZNF23	P17027	643 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	NDUFV2	P19404	249 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	DDC	P20711	480 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	CMPK1	P30085	196 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	MAGEA2	P43356	314 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	RABIF	P47224	123 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	ALDH3A2	P51648	485 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	DGKE	P52429	567 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	MAPK12	P53778	367 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	CCIN	Q13939	588 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	LRRC32	Q14392	662 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	RPE65	Q16518	533 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	NRF1	Q16656	503 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	ANKRD46	Q86W74	232 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	AVL9	Q8NBF6	648 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	ZFP90	Q8TF47	636 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	TFAP2C	Q92754	450 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	PYURF	Q96I23	114 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	CNBD2	Q96M20	576 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	SEPHS2	Q99611	448 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	INPP5K	Q9BT40	448 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	ADI1	Q9BV57	179 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	KCNK12	Q9HB15	430 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	USE1	Q9NZ43	259 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	BAG5	Q9UL15	447 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	SNX7	Q9UNH6	387 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	9.22	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		9.21	□□□□□ -0.93
UFD1-208	ENST00000484101	OR5K4	A6NMS3	321 aa		9.21	□□□□□ -0.94
UFD1-208	ENST00000484101	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		9.21	□□□□□ -0.94
UFD1-208	ENST00000484101	C10orf142	B7Z368	130 aa		9.21	□□□□□ -0.94
UFD1-208	ENST00000484101	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		9.21	□□□□□ -0.94
UFD1-208	ENST00000484101	SOCS2	O14508	198 aa		9.21	□□□□□ -0.94
UFD1-208	ENST00000484101	TPST1	O60507	370 aa		9.21	□□□□□ -0.94
UFD1-208	ENST00000484101	SERPINA1	P01009	418 aa		9.21	□□□□□ -0.94
UFD1-208	ENST00000484101	TGFB1	P01137	390 aa		9.21	□□□□□ -0.94
UFD1-208	ENST00000484101	SRF	P11831	508 aa		9.21	□□□□□ -0.94
UFD1-208	ENST00000484101	MYF6	P23409	242 aa		9.21	□□□□□ -0.94
UFD1-208	ENST00000484101	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	9.21	□□□□□ -0.94
UFD1-208	ENST00000484101	CAPG	P40121	348 aa		9.21	□□□□□ -0.94
UFD1-208	ENST00000484101	CDKN2C	P42773	168 aa		9.21	□□□□□ -0.94
UFD1-208	ENST00000484101	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	9.21	□□□□□ -0.94
UFD1-208	ENST00000484101	TPMT	P51580	245 aa		9.21	□□□□□ -0.94
UFD1-208	ENST00000484101	ARHGDIA	P52565	204 aa		9.21	□□□□□ -0.94
UFD1-208	ENST00000484101	TAS2R50	P59544	299 aa		9.21	□□□□□ -0.94
UFD1-208	ENST00000484101	PPP2CB	P62714	309 aa		9.21	□□□□□ -0.94
UFD1-208	ENST00000484101	PPP2CA	P67775	309 aa		9.21	□□□□□ -0.94
UFD1-208	ENST00000484101	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	9.21	□□□□□ -0.94
UFD1-208	ENST00000484101	TUBA4A	P68366	448 aa		9.21	□□□□□ -0.94
UFD1-208	ENST00000484101	CSNK1G2	P78368	415 aa		9.21	□□□□□ -0.94
UFD1-208	ENST00000484101	PLIN5	Q00G26	463 aa		9.21	□□□□□ -0.94
UFD1-208	ENST00000484101	RELA	Q04206	551 aa		9.21	□□□□□ -0.94
UFD1-208	ENST00000484101	C2orf80	Q0P641	193 aa		9.21	□□□□□ -0.94
UFD1-208	ENST00000484101	MERTK	Q12866	999 aa		9.21	□□□□□ -0.94
UFD1-208	ENST00000484101	DAG1	Q14118	895 aa		9.21	□□□□□ -0.94
UFD1-208	ENST00000484101	MLC1	Q15049	377 aa		9.21	□□□□□ -0.94
UFD1-208	ENST00000484101	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	9.21	□□□□□ -0.94
UFD1-208	ENST00000484101	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	9.21	□□□□□ -0.94
UFD1-208	ENST00000484101	GTDC1	Q4AE62	458 aa		9.21	□□□□□ -0.94

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