RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480171.7

PKP4-210, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 2

Gene PKP4, Length 2,772 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-210ENST00000480171 FAM217AQ8IXS0 508 aa8.36□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 SYTL1Q8IYJ3 562 aa8.36□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 SLC5A8Q8N695 610 aa8.36□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 CXorf40BQ96DE9 158 aa8.36□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 NDUFAF4Q9P032 175 aa8.36□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 SH3BP4Q9P0V3 963 aa8.36□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa8.36□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 C1orf226A1L170 272 aa8.36□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 LRRC72A6NJI9 287 aa8.36□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 GABRR3A8MPY1 467 aa8.36□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 AP2A2O94973 939 aa8.36□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 STSP08842 583 aa8.36□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 SLC10A3P09131 477 aa8.36□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 GSTM1P09488 218 aa8.36□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 GSTT2P0CG29 244 aa8.36□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 GSTT2BP0CG30 244 aa8.36□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 CENPAP49450 140 aa8.36□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 PRIM2P49643 509 aa8.36□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 MICAQ29983 383 aa8.36□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 SYTL3Q4VX76 610 aa8.36□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa8.36□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 PRSS36Q5K4E3 855 aa8.36□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 SPANXN2Q5MJ10 180 aa8.36□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP8.36□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 MPP7Q5T2T1 576 aa8.36□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 ATAD3BQ5T9A4 648 aa8.36□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 ZNF367Q7RTV3 350 aa8.36□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 LGI4Q8N135 537 aa8.36□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 NAGSQ8N159 534 aa8.36□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 FIBINQ8TAL6 211 aa8.36□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 COQ8BQ96D53 544 aa8.36□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 ECHDC3Q96DC8 303 aa8.36□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 MED8Q96G25 268 aa8.36□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 EHD1Q9H4M9 534 aa8.36□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 AMBNQ9NP70 447 aa8.36□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa8.36□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 MKLN1Q9UL63 735 aa8.36□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa8.36□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa8.36□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 KLK4Q9Y5K2 254 aa8.36□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 EFCAB10A6NFE3 127 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 E7EQ34 232 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 QSOX1O00391 747 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 ZNF197O14709 1029 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 HAT1O14929 419 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 YY2O15391 372 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 MPZL2O60487 215 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 GREM1O60565 184 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 CATP04040 527 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 ADORA3P0DMS8 318 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 SRCP12931 536 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 IDSP22304 550 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 LHCGRP22888 699 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 RGS6P49758 472 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 NUDT6P53370 316 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 PNLIPRP1P54315 467 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 CDH12P55289 794 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 CDC42P60953 191 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 ST3GAL4Q11206 333 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 DMC1Q14565 340 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 NDUFA5Q16718 116 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 GCNT6Q5T4J0 391 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 DEPDC1Q5TB30 811 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 HEATR4Q86WZ0 1026 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 CCDC103Q8IW40 242 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 PARP16Q8N5Y8 322 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 ANKK1Q8NFD2 765 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 PIK3R3Q92569 461 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 MAL2Q969L2 176 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 REPS1Q96D71 796 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 CEP19Q96LK0 163 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 SLC22A12Q96S37 553 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 RAD18Q9NS91 495 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 GPR83Q9NYM4 423 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 BTBD3Q9Y2F9 522 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 DSCR3O14972 297 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 TLL1O43897 1013 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 AOC2O75106 756 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 POP4O95707 220 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 C1SP09871 688 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 HSMCR30P0CW71 290 aa8.35□□□□□ -1.07
PKP4-210ENST00000480171 CD22P20273 847 aa8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms