RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456943.6

GMDS-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GMDS-AS1, Length 2,308 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KLHL18O94889 574 aa16.62■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SERPIND1P05546 499 aa16.62■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DDCP20711 480 aa16.62■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CD6P30203 668 aa16.62■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 AHRP35869 848 aa16.62■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CHN2P52757 468 aa16.62■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 C6orf52Q5T4I8 152 aa16.62■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ENPP6Q6UWR7 440 aa16.62■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 EPHX4Q8IUS5 362 aa16.62■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZZZ3Q8IYH5 903 aa16.62■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 OR13H1Q8NG92 308 aa16.62■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NETO1Q8TDF5 533 aa16.62■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DPH7Q9BTV6 452 aa16.62■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RAD21L1Q9H4I0 556 aa16.62■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LMAN1LQ9HAT1 526 aa16.62■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RPS6KA6Q9UK32 745 aa16.62■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CA14Q9ULX7 337 aa16.62■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa16.61■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa16.61■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KCNK5O95279 499 aa16.61■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RASAL1O95294 804 aa16.61■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 C6orf47O95873 294 aa16.61■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 VEZF1Q14119 521 aa16.61■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TRIM48Q8IWZ4 208 aa16.61■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MFSD2AQ8NA29 543 aa16.61■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 OR4E2Q8NGC2 313 aa16.61■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CCL4L1Q8NHW4 92 aa16.61■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FAM174AQ8TBP5 190 aa16.61■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CREB3L4Q8TEY5 395 aa16.61■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CNBD2Q96M20 576 aa16.61■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SARGQ9BW04 601 aa16.61■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GSDMCQ9BYG8 508 aa16.61■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SRMSQ9H3Y6 488 aa16.61■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa16.61■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PDP2Q9P2J9 529 aa16.61■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa16.61■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 AK5Q9Y6K8 562 aa16.61■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa16.61■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FANCMQ8IYD8 2048 aa16.61■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 A0A1W2PRB8 838 aa16.61■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 C7orf72A4D263 438 aa16.61■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RTCAO00442 366 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PRKD3O94806 890 aa16.61■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 EML2O95834 649 aa16.61■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MT-ND1P03886 318 aa16.61■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZNF23P17027 643 aa16.61■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CLCN2P51788 898 aa16.61■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ARFIP1P53367 373 aa16.61■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HBA1P69905 142 aa16.61■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GAB1Q13480 694 aa16.61■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PLCL1Q15111 1095 aa16.61■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TCEA2Q15560 299 aa16.61■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PLD3Q8IV08 490 aa16.61■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GPR174Q9BXC1 333 aa16.61■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SPHK1Q9NYA1 384 aa16.61■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TAS2R9Q9NYW1 312 aa16.61■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 XIRP2A4UGR9 3374 aa16.6■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 A6NCN8 305 aa16.6■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 BCL6P41182 706 aa16.6■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SSR2P43308 183 aa16.6■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RGNQ15493 299 aa16.6■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 OR4C11Q6IEV9 310 aa16.6■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FAM47BQ8NA70 645 aa16.6■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZFPM2Q8WW38 1151 aa16.6■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SDCCAG3Q96C92 435 aa16.6■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TM4SF18Q96CE8 201 aa16.6■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PYURFQ96I23 114 aa16.6■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SLC35A5Q9BS91 424 aa16.6■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DNAJB9Q9UBS3 223 aa16.6■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ERVK-11Q9UQG0 969 aa16.6■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HAT1O14929 419 aa16.59■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SLC19A1P41440 591 aa16.59■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KIR2DS3Q14952 304 aa16.59■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TEAD4Q15561 434 aa16.59■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZIC1Q15915 447 aa16.59■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 UGT2A3Q6UWM9 527 aa16.59■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa16.59■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP16.59■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FBXL6Q8N531 539 aa16.59■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SLC6A16Q9GZN6 736 aa16.59■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TAAR2Q9P1P5 351 aa16.59■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LRIT2A6NDA9 550 aa16.59■□□□□ 0.25
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PDLIM1O00151 329 aa16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms