RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445722.2

RBBP4-205, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 2

Gene RBBP4, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-205	ENST00000445722	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
RBBP4-205	ENST00000445722	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBBP4-205	ENST00000445722	ZNF860	A6NHJ4	632 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBBP4-205	ENST00000445722	MASP2	O00187	686 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBBP4-205	ENST00000445722	CHST10	O43529	356 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBBP4-205	ENST00000445722	JRK	O75564	520 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBBP4-205	ENST00000445722	WFS1	O76024	890 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBBP4-205	ENST00000445722	UQCRH	P07919	91 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBBP4-205	ENST00000445722	RBP1	P09455	135 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBBP4-205	ENST00000445722	GFAP	P14136	432 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBBP4-205	ENST00000445722	EPB42	P16452	691 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBBP4-205	ENST00000445722	MAGEA12	P43365	314 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBBP4-205	ENST00000445722	KCNC1	P48547	511 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBBP4-205	ENST00000445722	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RBBP4-205	ENST00000445722	RAB8A	P61006	207 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBBP4-205	ENST00000445722	IRF9	Q00978	393 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBBP4-205	ENST00000445722		Q0VFX4	171 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBBP4-205	ENST00000445722	HYAL2	Q12891	473 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBBP4-205	ENST00000445722	CHIT1	Q13231	466 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBBP4-205	ENST00000445722	MFAP5	Q13361	173 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBBP4-205	ENST00000445722	DOC2A	Q14183	400 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBBP4-205	ENST00000445722	RCN2	Q14257	317 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBBP4-205	ENST00000445722	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RBBP4-205	ENST00000445722	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBBP4-205	ENST00000445722	SETDB1	Q15047	1291 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBBP4-205	ENST00000445722	EXT1	Q16394	746 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBBP4-205	ENST00000445722	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBBP4-205	ENST00000445722	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBBP4-205	ENST00000445722	TRIM40	Q6P9F5	258 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBBP4-205	ENST00000445722	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBBP4-205	ENST00000445722		Q6ZS92	163 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBBP4-205	ENST00000445722	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBBP4-205	ENST00000445722	ESAM	Q96AP7	390 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBBP4-205	ENST00000445722	MFRP	Q9BY79	579 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBBP4-205	ENST00000445722	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBBP4-205	ENST00000445722	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBBP4-205	ENST00000445722	LANCL2	Q9NS86	450 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBBP4-205	ENST00000445722	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBBP4-205	ENST00000445722	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBBP4-205	ENST00000445722	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBBP4-205	ENST00000445722	DYTN	A2CJ06	578 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	LRIT2	A6NDA9	550 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	ERI3	O43414	337 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	KLK8	O60259	260 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	UGDH	O60701	494 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	VPS4B	O75351	444 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	MTHFD2	P13995	350 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	HNF4A	P41235	474 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	GLRB	P48167	497 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	MLLT10	P55197	1068 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	RHAG	Q02094	409 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	NSDHL	Q15738	373 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	MED27	Q6P2C8	311 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722		Q8NA96	180 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	OR2L5	Q8NG80	312 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	DCAKD	Q8WVC6	231 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	MTBP	Q96DY7	904 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	LPAR4	Q99677	370 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	FETUB	Q9UGM5	382 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	VPS4A	Q9UN37	437 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	B3GALT2	O43825	422 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	PRMT3	O60678	531 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	EPOR	P19235	508 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	SOX11	P35716	441 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	GMPR	P36959	345 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	BTN3A2	P78410	334 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	PHEX	P78562	749 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	13.76	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	TLR1	Q15399	786 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	PFKFB4	Q16877	469 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	LIPJ	Q5W064	366 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	LCA5	Q86VQ0	697 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	M1AP	Q8TC57	530 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	13.76	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	REPS1	Q96D71	796 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	GPR78	Q96P69	363 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	SERINC2	Q96SA4	455 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBBP4-205	ENST00000445722	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		13.76	□□□□□ -0.21

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