RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440835.6

PTPRR-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 2,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-204ENST00000440835 NAT8LQ8N9F0 302 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 SLC38A9Q8NBW4 561 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 OR4K2Q8NGD2 314 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 OR52E1Q8NGJ3 308 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 NDC1Q9BTX1 674 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 LRRC40Q9H9A6 602 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 PLGRKTQ9HBL7 147 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 ACTL7BQ9Y614 415 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 ESPL1Q14674 2120 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 TRIM64A6NGJ6 449 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 TRIM64BA6NI03 449 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 B2RBV5 119 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 TARM1B6A8C7 271 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 CDH16O75309 829 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 MLNP12872 115 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 MMP11P24347 488 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 GRK2P25098 689 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 PTGER4P35408 488 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 MYBPC1Q00872 1141 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 SP140Q13342 867 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 KCNJ11Q14654 390 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 BBS9Q3SYG4 887 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 DCDC5Q6ZRR9 648 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 RAB42Q8N4Z0 105 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 OR5K2Q8NHB8 316 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 ACTRT2Q8TDY3 377 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 TRPC4APQ8TEL6 797 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 ALPK1Q96QP1 1244 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 TBL1YQ9BQ87 522 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 NAT9Q9BTE0 207 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 HGH1Q9BTY7 390 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 NDEL1Q9GZM8 345 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 EPS8L2Q9H6S3 715 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 GPAMQ9HCL2 828 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 S100A14Q9HCY8 104 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 P4HTMQ9NXG6 502 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 WDR91A4D1P6 747 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 BTN3A3O00478 584 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 DSCR3O14972 297 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 KPNA5O15131 536 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 SEMA7AO75326 666 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 S1PR4O95977 384 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 OR56A5P0C7T3 313 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 ST6GAL1P15907 406 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 UGT2B7P16662 529 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 S100A1P23297 94 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 GDF10P55107 478 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 APOFQ13790 326 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 NR6A1Q15406 480 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 FAM214AQ32MH5 1076 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 C1orf146Q5VVC0 180 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 PLBD1Q6P4A8 553 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 OVCH1Q7RTY7 1134 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 OR8H1Q8NGG4 311 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 DNAJB8Q8NHS0 232 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 ZUFSPQ96AP4 578 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 TMIGD2Q96BF3 282 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF285Q96NJ3 590 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 AGAP4Q96P64 663 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 THTPAQ9BU02 230 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 TUBB6Q9BUF5 446 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 CEP41Q9BYV8 373 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 LUZP4Q9P127 313 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 FKBPLQ9UIM3 349 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 A0A1B0GX78 115 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 ARHGAP10A1A4S6 786 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 FITM1A5D6W6 292 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 E7ESA3 106 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 K7EPI3 171 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 FCHO1O14526 889 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 APRTP07741 180 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRR-204ENST00000440835 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms