RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437713.5

TTC28-AS1-216, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 854 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 OR9A4Q8NGU2 314 aa7.7□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ACMSDQ8TDX5 336 aa7.7□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CREB3L4Q8TEY5 395 aa7.7□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 METTL21AQ8WXB1 218 aa7.7□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TRIM55Q9BYV6 548 aa7.7□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PSD3Q9NYI0 1048 aa7.7□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GPR83Q9NYM4 423 aa7.7□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DCDC2Q9UHG0 476 aa7.7□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa7.7□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa7.7□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa7.7□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa7.7□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LOC400499M0QZD8 3231 aa7.7□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CCDC88CQ9P219 2028 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LRIT2A6NDA9 550 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SGK494L7N484 410 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SUV39H1O43463 412 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SMIM24O75264 130 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ALOX12BO75342 701 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HPP00738 406 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PRB1P04280 392 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TUBBP07437 444 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GSTA1P08263 222 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ACPPP15309 386 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IL1RNP18510 177 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 EPORP19235 508 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 JAK1P23458 1154 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GCAP28676 217 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GLRBP48167 497 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 AGTR2P50052 363 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ARFIP1P53367 373 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HYAL2Q12891 473 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RCN2Q14257 317 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PFKFB4Q16877 469 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ADPRMQ3LIE5 342 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TMEM35AQ53FP2 167 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TECRLQ5HYJ1 363 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FAM69BQ5VUD6 431 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CPZQ66K79 652 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MED27Q6P2C8 311 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IGFL3Q6UXB1 125 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ATG14Q6ZNE5 492 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ASB18Q6ZVZ8 466 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LAS2Q8IYD9 372 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DTWD1Q8N5C7 304 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TEX9Q8N6V9 391 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TEX19Q8NA77 164 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LRRN4CLQ8ND94 238 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 C7orf57Q8NEG2 295 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 OR11G2Q8NGC1 345 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GAL3ST3Q96A11 431 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ESAMQ96AP7 390 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 REPS1Q96D71 796 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MOCOSQ96EN8 888 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FAR2Q96K12 515 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MACROD1Q9BQ69 325 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ROGDIQ9GZN7 287 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SPNS1Q9H2V7 528 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 EPB41L4BQ9H329 900 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FBXL4Q9UKA2 621 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MKL2Q9ULH7 1088 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ATRXP46100 2492 aa7.69□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa7.68□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CHST10O43529 356 aa7.68□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DPM1O60762 260 aa7.68□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PRAMEF4O60810 478 aa7.68□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 C8orf89P0DMQ9 161 aa7.68□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MYBL2P10244 700 aa7.68□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TAC1P20366 129 aa7.68□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PIK3CBP42338 1070 aa7.68□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TSFMP43897 325 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 XCR1P46094 333 aa7.68□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CHAF1BQ13112 559 aa7.68□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.6 ms