RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436638.5

ECHDC1-208, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene ECHDC1, Length 766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-208ENST00000436638 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 MTBPQ96DY7 904 aa5.96□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 LINGO1Q96FE5 620 aa5.96□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 CABS1Q96KC9 395 aa5.96□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa5.96□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 APOLD1Q96LR9 279 aa5.96□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 GPR22Q99680 433 aa5.96□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 TXN2Q99757 166 aa5.96□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 HIST1H2AJQ99878 128 aa5.96□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 SELENOSQ9BQE4 189 aa5.96□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 H2AFJQ9BTM1 129 aa5.96□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 TRIM54Q9BYV2 358 aa5.96□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 C1orf21Q9H246 121 aa5.96□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 RAD21L1Q9H4I0 556 aa5.96□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 MVB12BQ9H7P6 319 aa5.96□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 POPDC3Q9HBV1 291 aa5.96□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 ADPRHL2Q9NX46 363 aa5.96□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 LRIT1Q9P2V4 623 aa5.96□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 CPNE7Q9UBL6 633 aa5.96□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 PADI4Q9UM07 663 aa5.96□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 BTBD3Q9Y2F9 522 aa5.96□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 PCDH15Q96QU1 1955 aa5.96□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 GON4LQ3T8J9 2241 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 PI4KAP42356 2102 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 A0A087X1B8 175 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 WDR91A4D1P6 747 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 A6NLC8 198 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 OR52A4PA6NMU1 304 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 TRIM49D1C9J1S8 452 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 NDUFS8O00217 210 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 SLC30A4O14863 429 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 NOBOXO60393 691 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 CDH16O75309 829 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 SLCO2B1O94956 709 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 SYF2O95926 243 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 SHBGP04278 402 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 MPOP05164 745 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 NUDT17P0C025 328 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 GIMD1P0DJR0 217 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 AMD1P17707 334 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 DDX5P17844 614 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 CYP2A7P20853 494 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 CFL1P23528 166 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 CCND1P24385 295 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 PDHA2P29803 388 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 CCNFP41002 786 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 SLCO1A2P46721 670 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 HSPA13P48723 471 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 HK2P52789 917 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 CDKN2DP55273 166 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 BTKQ06187 659 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 EGR3Q06889 387 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 PRKAA1Q13131 559 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 DNAJC3Q13217 504 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 BMPR2Q13873 1038 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 CASP8Q14790 479 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 CLCA4Q14CN2 919 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 MOGQ16653 247 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 ZNF674Q2M3X9 581 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 CCDC157Q569K6 752 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 ARMC6Q6NXE6 501 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 ERICH5Q6P6B1 374 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 KLHL35Q6PF15 583 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 FRA10AC1Q70Z53 315 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 PIM3Q86V86 326 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 SLC22A9Q8IVM8 553 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 SLC35F3Q8IY50 421 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 SFRP1Q8N474 314 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 ACVR1CQ8NER5 493 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 DEFB124Q8NES8 71 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 OR6S1Q8NH40 331 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 OR10G6Q8NH81 332 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 CD200R1Q8TD46 325 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 MCOLN3Q8TDD5 553 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 DCAKDQ8WVC6 231 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 PATE1Q8WXA2 126 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 TMEM131Q92545 1883 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 SLC9A6Q92581 669 aa5.95□□□□□ -1.46
ECHDC1-208ENST00000436638 RAD51AP1Q96B01 352 aa5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms