RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431908.5

DDX39B-210, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 5

Gene DDX39B, Length 914 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-210ENST00000431908 ABHD11Q8NFV4 315 aa11.14□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa11.14□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 CHTF18Q8WVB6 975 aa11.14□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 PYCR2Q96C36 320 aa11.14□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 LURAP1Q96LR2 239 aa11.14□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 AIF1LQ9BQI0 150 aa11.14□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 DEFB126Q9BYW3 111 aa11.14□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 ACBD3Q9H3P7 528 aa11.14□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 ZFP69BQ9UJL9 534 aa11.14□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 ZNF835Q9Y2P0 537 aa11.14□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 MEMO1Q9Y316 297 aa11.14□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 CACNA1CQ13936 2221 aa11.13□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 PKDREJQ9NTG1 2253 aa11.13□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 GUCA1CO95843 209 aa11.13□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 RHOXF2BP0C7M4 288 aa11.13□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 RNH1P13489 461 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 CAPN3P20807 821 aa11.13□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 MAGEA3P43357 314 aa11.13□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 VSNL1P62760 191 aa11.13□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 CYP1B1Q16678 543 aa11.13□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 STRA8Q7Z7C7 330 aa11.13□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 CREG2Q8IUH2 290 aa11.13□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 CEP97Q8IW35 865 aa11.13□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 OR4K1Q8NGD4 311 aa11.13□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 OR5T3Q8NGG3 340 aa11.13□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 NT5CQ8TCD5 201 aa11.13□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 ELP5Q8TE02 316 aa11.13□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 SLC5A11Q8WWX8 675 aa11.13□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 TSLPQ969D9 159 aa11.13□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 MS4A14Q96JA4 679 aa11.13□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 FAR2Q96K12 515 aa11.13□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 FRMD6Q96NE9 622 aa11.13□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 OLFM1Q99784 485 aa11.13□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 RHOXF2Q9BQY4 288 aa11.13□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 CCDC77Q9BR77 488 aa11.13□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 SARGQ9BW04 601 aa11.13□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 HES7Q9BYE0 225 aa11.13□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 VIPAS39Q9H9C1 493 aa11.13□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 PRDM9Q9NQV7 894 aa11.13□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 LANCL2Q9NS86 450 aa11.13□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 ASIC3Q9UHC3 531 aa11.13□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa11.13□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 SH2B3Q9UQQ2 575 aa11.13□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 KCNE2Q9Y6J6 123 aa11.13□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 LRBAP50851 2863 aa11.12□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 A0A088AWK7 358 aa11.12□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 E9PLN8 166 aa11.12□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 CES2O00748 559 aa11.12□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 TFECO14948 347 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 NME2P1O60361 137 aa11.12□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 AHSGP02765 367 aa11.12□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 NME2P22392 152 aa11.12□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 HPDP32754 393 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 PAFAH1B1P43034 410 aa11.12□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 FNTAP49354 379 aa11.12□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 ST13P50502 369 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 HLCSP50747 726 aa11.12□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 CLCN2P51788 898 aa11.12□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 OLR1P78380 273 aa11.12□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 ADORA2A-AS1P86434 159 aa11.12□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 PHKG1Q16816 387 aa11.12□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 TMEM211Q6ICI0 200 aa11.12□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 FAM45BPQ6NSW5 357 aa11.12□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 PAOXQ6QHF9 649 aa11.12□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 QSOX2Q6ZRP7 698 aa11.12□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 PDIK1LQ8N165 341 aa11.12□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa11.12□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 TMEM156Q8N614 296 aa11.12□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 OR56A3Q8NH54 315 aa11.12□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 FAM45AQ8TCE6 357 aa11.12□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa11.12□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 AGAP11Q8TF27 550 aa11.12□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 FBXL8Q96CD0 374 aa11.12□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 CERS2Q96G23 380 aa11.12□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 OSBPL9Q96SU4 736 aa11.12□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 EGFL8Q99944 293 aa11.12□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 VKORC1Q9BQB6 163 aa11.12□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 RHBGQ9H310 441 aa11.12□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 PRM3Q9NNZ6 103 aa11.12□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 VWA7Q9Y334 891 aa11.12□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 ABCA12Q86UK0 2595 aa11.11□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 SAGE2PA6NJ88 616 aa11.11□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 A8MUA0 341 aa11.11□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 CLDN4O14493 209 aa11.11□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 NEURL1O76050 574 aa11.11□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 HNF4AP41235 474 aa11.11□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 ITGA8P53708 1063 aa11.11□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 CDKN2DP55273 166 aa11.11□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 MLF1P58340 268 aa11.11□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 RAB8AP61006 207 aa11.11□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
DDX39B-210ENST00000431908 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms