RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425660.5

ACTB-204, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-204ENST00000425660 IL3P08700 152 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 TSFMP43897 325 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 FASLGP48023 281 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 GZMMP51124 257 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 MAPK12P53778 367 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 OR4D2P58180 307 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 MC1RQ01726 317 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 C2orf80Q0P641 193 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 ZNF385BQ569K4 471 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 OR4C11Q6IEV9 310 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 CALHM3Q86XJ0 350 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 CLECL1Q8IZS7 167 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 AVL9Q8NBF6 648 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 OR2T12Q8NG77 320 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 OR10A6Q8NH74 314 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 SLCO4A1Q96BD0 722 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 PPCDCQ96CD2 204 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 MS4A6EQ96DS6 147 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 SH3BP4Q9P0V3 963 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 C15orf41Q9Y2V0 281 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 A0A0A6YYD5 115 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 ARHGAP10A1A4S6 786 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 C1orf226A1L170 272 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 GSNP06396 782 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 DDCP20711 480 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 KLC1Q07866 573 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 DMWDQ09019 674 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 SLC5A12Q1EHB4 618 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 MPEG1Q2M385 716 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 SPESP1Q6UW49 350 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 GKN2Q86XP6 184 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 SPPL2CQ8IUH8 684 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 TMEFF1Q8IYR6 380 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 DTWD1Q8N5C7 304 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 TNIP2Q8NFZ5 429 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 OR52E4Q8NGH9 312 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 TM4SF18Q96CE8 201 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 SLC6A16Q9GZN6 736 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 ARMC1Q9NVT9 282 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 RIMS3Q9UJD0 308 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 USP22Q9UPT9 525 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 KLHL20Q9Y2M5 609 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 LRRC42Q9Y546 428 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 AP4S1Q9Y587 144 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 LAMA1P25391 3075 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 TCRBV5S2A0A599 114 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 ZW10O43264 779 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 TMPRSS11DO60235 418 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 CAPNS1P04632 268 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 GPX2P18283 190 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 GGT1P19440 569 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 MAGP20916 626 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.092e-7■□□□□ 8.8
ACTB-204ENST00000425660 ABHD18Q0P651 414 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 HEPACAMQ14CZ8 416 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 MUM1Q2TAK8 710 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 FBXO42Q6P3S6 717 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 ABHD17CQ6PCB6 329 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 VN1R4Q7Z5H5 301 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 SERPINA11Q86U17 422 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 OR2L5Q8NG80 312 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 OR10G6Q8NH81 332 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 CANT1Q8WVQ1 401 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 KCNC2Q96PR1 638 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 OR2A5Q96R48 311 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 GORASP2Q9H8Y8 452 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 UCK1Q9HA47 277 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 HRASLS2Q9NWW9 162 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 SPASTQ9UBP0 616 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 PILRAQ9UKJ1 303 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 GON4LQ3T8J9 2241 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 GSAPA4D1B5 854 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 OR5K3A6NET4 321 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 FAM220BPB1ANY3 271 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 CLIC1O00299 241 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 GPR37L1O60883 481 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 GPIP06744 558 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 PLA2G16P53816 162 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 TJAP1Q5JTD0 557 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 WDR45BQ5MNZ6 344 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 FCRL6Q6DN72 434 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 ZNF793Q6ZN11 406 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 LILRA2Q8N149 483 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 C10orf111Q8N326 155 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-204ENST00000425660 NATD1Q8N6N6 113 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.6 ms