RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421832.2

CTU1-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTU1, Length 2,087 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1-201ENST00000421832 C11orf74Q86VG3 221 aa23.42■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 CADM3Q8N126 398 aa23.42■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 FAM46DQ8NEK8 389 aa23.42■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 LMX1AQ8TE12 382 aa23.42■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 ACTR8Q9H981 624 aa23.42■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 POLG2Q9UHN1 485 aa23.42■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa23.42■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 FFAR3O14843 346 aa23.42■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 PIP5K1BO14986 540 aa23.42■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 GPR42O15529 346 aa23.42■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 UROSP10746 265 aa23.42■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 BNIP2Q12982 314 aa23.42■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 CEP68Q76N32 757 aa23.42■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 SFRP1Q8N474 314 aa23.42■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 METTL6Q8TCB7 284 aa23.42■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 CYGBQ8WWM9 190 aa23.42■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 NEIL2Q969S2 332 aa23.42■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 CXorf40BQ96DE9 158 aa23.42■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 HBEGFQ99075 208 aa23.42■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 ACAT2Q9BWD1 397 aa23.42■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 SNX11Q9Y5W9 270 aa23.42■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa23.41■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 DHRS12A0PJE2 317 aa23.41■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 NRP2O60462 931 aa23.41■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 ATP6AP2O75787 350 aa23.41■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 EBLN1P0CF75 366 aa23.41■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 CD22P20273 847 aa23.41■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 PSMB5P28074 263 aa23.41■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 GRIA3P42263 894 aa23.41■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 CHIT1Q13231 466 aa23.41■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 ARHGAP19Q14CB8 494 aa23.41■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 ABHD11Q8NFV4 315 aa23.41■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 SLC37A2Q8TED4 501 aa23.41■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 PIGKQ92643 395 aa23.41■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 C11orf16Q9NQ32 467 aa23.41■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 FSCN3Q9NQT6 498 aa23.41■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 UCKL1Q9NWZ5 548 aa23.41■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa23.41■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 A0A1W2PPV9 198 aa23.4■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 ACOX3O15254 700 aa23.4■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 CLDN9O95484 217 aa23.4■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 HGFP14210 728 aa23.4■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 PKLRP30613 574 aa23.4■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 RAB28P51157 221 aa23.4■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 NEDD8Q15843 81 aa23.4■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 BROXQ5VW32 411 aa23.4■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 LCN8Q6JVE9 175 aa23.4■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 HMGCLL1Q8TB92 370 aa23.4■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 MEAF6Q9HAF1 191 aa23.4■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 IFT52Q9Y366 437 aa23.4■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa23.4■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 BBIP1A8MTZ0 92 aa23.4■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 B4DGG1 531 aa23.4■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 JRKO75564 520 aa23.4■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 LINC00032P0C843 101 aa23.4■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 ATP6V1B2P21281 511 aa23.4■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 CTSKP43235 329 aa23.4■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 CD300CQ08708 224 aa23.4■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP23.4■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 AGKQ53H12 422 aa23.4■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa23.4■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa23.4■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 DDIASQ8IXT1 998 aa23.4■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 ZBTB44Q8NCP5 570 aa23.4■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 C19orf60Q96EN9 201 aa23.4■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 VMP1Q96GC9 406 aa23.4■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa23.4■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 ZSCAN32Q9NX65 697 aa23.4■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 GIMAP2Q9UG22 337 aa23.4■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa23.39■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 YY2O15391 372 aa23.39■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 DNAJB5O75953 348 aa23.39■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 GPIP06744 558 aa23.39■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 ELOCQ15369 112 aa23.39■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 CYBRD1Q53TN4 286 aa23.39■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 CATSPEREQ5SY80 951 aa23.39■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 PARP8Q8N3A8 854 aa23.39■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa23.39■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 MUC13Q9H3R2 512 aa23.39■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 CPNE7Q9UBL6 633 aa23.39■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 TRPS1Q9UHF7 1281 aa23.39■■□□□ 1.34
CTU1-201ENST00000421832 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa23.39■■□□□ 1.33
CTU1-201ENST00000421832 UBDO15205 165 aa23.39■■□□□ 1.33
CTU1-201ENST00000421832 HSD17B1P14061 328 aa23.39■■□□□ 1.33
CTU1-201ENST00000421832 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.33
CTU1-201ENST00000421832 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
CTU1-201ENST00000421832 IRF8Q02556 426 aa23.39■■□□□ 1.33
CTU1-201ENST00000421832 DOC2AQ14183 400 aa23.39■■□□□ 1.33
CTU1-201ENST00000421832 TEAD4Q15561 434 aa23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms