RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 ZNF846Q147U1 533 aa22.82■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 C16orf87Q6PH81 154 aa22.82■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 IKBIPQ70UQ0 350 aa22.82■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 ZNF554Q86TJ5 538 aa22.82■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 TMIEQ8NEW7 156 aa22.82■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 S100ZQ8WXG8 99 aa22.82■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 S1PR5Q9H228 398 aa22.82■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 EPS8L2Q9H6S3 715 aa22.82■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 SFXN1Q9H9B4 322 aa22.82■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 DMRT3Q9NQL9 472 aa22.82■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 THSD1Q9NS62 852 aa22.82■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 GULP1Q9UBP9 304 aa22.82■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 GPR34Q9UPC5 381 aa22.82■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 GPR37L1O60883 481 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 XYLBO75191 536 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 POU2F2P09086 479 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 PDHA2P29803 388 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 DGKGP49619 791 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 RPP38P78345 283 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 PHEXP78562 749 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 TMPRSS11BQ86T26 416 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 NAGSQ8N159 534 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 OXR1Q8N573 874 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 SORCS1Q8WY21 1168 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 PPP1R16AQ96I34 528 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 MSLNLQ96KJ4 702 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 SH3BP4Q9P0V3 963 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 WNT6Q9Y6F9 365 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 IFNA14P01570 189 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 FURINP09958 794 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 ANXA8P13928 327 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 ITGA2P17301 1181 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 FMO3P31513 532 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 GRK3P35626 688 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 TRIM40Q6P9F5 258 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 METTL4Q8N3J2 472 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 SLC15A4Q8N697 577 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 TPD52L3Q96J77 140 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 PSD2Q9BQI7 771 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 HMG20AQ9NP66 347 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 EXD2Q9NVH0 621 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 DPP7Q9UHL4 492 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 ERGIC3Q9Y282 383 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 CLDN25C9JDP6 229 aa22.8■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 SOD1P00441 154 aa22.8■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 ITGB7P26010 798 aa22.8■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 WEE1P30291 646 aa22.8■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 CLCA4Q14CN2 919 aa22.8■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 DHCR24Q15392 516 aa22.8■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 TBC1D25Q3MII6 688 aa22.8■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 ANKDD1AQ495B1 522 aa22.8■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 GCNT6Q5T4J0 391 aa22.8■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 FAM71E1Q6IPT2 247 aa22.8■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 NXPE4Q6UWF7 544 aa22.8■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 COMMD6Q7Z4G1 85 aa22.8■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 FAM124AQ86V42 546 aa22.8■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 SYTL1Q8IYJ3 562 aa22.8■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 NATD1Q8N6N6 113 aa22.8■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 NAT16Q8N8M0 369 aa22.8■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 ZNF540Q8NDQ6 660 aa22.8■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 ACOT13Q9NPJ3 140 aa22.8■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 DZANK1Q9NVP4 752 aa22.8■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 FAM8A1Q9UBU6 413 aa22.8■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 PIPSLA2A3N6 862 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 FAM20BO75063 409 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 DIRAS1O95057 198 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 NUDT7P0C024 238 aa22.79■■□□□ 1.24
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PMS1-205ENST00000409985 MAPK10P53779 464 aa22.79■■□□□ 1.24
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PMS1-205ENST00000409985 UBE2UQ5VVX9 321 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 DCDC5Q6ZRR9 648 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 P2RY8Q86VZ1 359 aa22.79■■□□□ 1.24
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PMS1-205ENST00000409985 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 RUBCNLQ9H714 662 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 ANKHQ9HCJ1 492 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 TRIM39Q9HCM9 518 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 NDUFAF4Q9P032 175 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 CLDN24A6NM45 220 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 PI15O43692 258 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 SULT1C4O75897 302 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 CYP4B1P13584 511 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 IL1RL1Q01638 556 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 TAP2Q03519 686 aa22.79■■□□□ 1.24
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