RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409364.3

GTF3C3-202, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF3C3, Length 1,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3-202ENST00000409364 FURINP09958 794 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 CMPK1P30085 196 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 SHMT2P34897 504 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 BSGP35613 385 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 AHRP35869 848 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 RABIFP47224 123 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 CHN2P52757 468 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 MAPK12P53778 367 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 SRP54P61011 504 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 MYBPC3Q14896 1274 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 HEPACAMQ14CZ8 416 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 VMACQ2NL98 169 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 SYT13Q7L8C5 426 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 RD3Q7Z3Z2 195 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 SPRED1Q7Z699 444 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 AMIGO1Q86WK6 493 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 CBR4Q8N4T8 237 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 ANKRD53Q8N9V6 530 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 OR4A15Q8NGL6 344 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 WDR48Q8TAF3 677 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 FAM174AQ8TBP5 190 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 NETO1Q8TDF5 533 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 HMGB4Q8WW32 186 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 LCN9Q8WX39 176 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 NCLNQ969V3 563 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 PYURFQ96I23 114 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 F2RL3Q96RI0 385 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 SARGQ9BW04 601 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 RAD21L1Q9H4I0 556 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 XKR8Q9H6D3 395 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 MIEF1Q9NQG6 463 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 DNAJB9Q9UBS3 223 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 TBC1D29Q9UFV1 150 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 EBF1Q9UH73 591 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 RPS6KA6Q9UK32 745 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 ICKQ9UPZ9 632 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 ERVK-11Q9UQG0 969 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 A0A1W2PRB8 838 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 FEZF1A0PJY2 475 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 C1orf226A1L170 272 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 FAM149AA5PLN7 773 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 SAC3D1A6NKF1 404 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 C10orf142B7Z368 130 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 PLPP1O14494 284 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 SOCS2O14508 198 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 ACOX3O15254 700 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 NARSO43776 548 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 GUCY1B2O75343 617 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 ZNF217O75362 1048 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 PRKD3O94806 890 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 KLHL18O94889 574 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 KRT75O95678 551 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 GBAP04062 536 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 FAM58BPP0C7Q3 252 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 CHRNB1P11230 501 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 DRD2P14416 443 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 DDCP20711 480 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 CD72P21854 359 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 PSMB5P28074 263 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 KDELR2P33947 212 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 ACTR1BP42025 376 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 ACTR1AP61163 376 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 RBBP4Q09028 425 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 LRRC32Q14392 662 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 RGNQ15493 299 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 TEAD4Q15561 434 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 NHSL2Q5HYW2 709 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 C6orf52Q5T4I8 152 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 KIAA0895LQ68EN5 471 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 OR4C11Q6IEV9 310 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 TRIM40Q6P9F5 258 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 UGT2A3Q6UWM9 527 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 Q6ZSR6 202 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 ADCK2Q7Z695 626 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 NUDT13Q86X67 352 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 ADHFE1Q8IWW8 467 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 CLECL1Q8IZS7 167 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C3-202ENST00000409364 FAM47BQ8NA70 645 aa5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms