RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391218.1

RNU6-1250P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1250, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1250P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1250P-201ENST00000391218 APOC4P55056 127 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 RPS16P62249 146 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 RPL8P62917 257 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 NOP14P78316 857 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 SLC7A9P82251 487 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 CD164Q04900 197 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 CD47Q08722 323 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 PPIL2Q13356 520 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 IL13RA2Q14627 380 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 NAB2Q15742 525 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 EXT1Q16394 746 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 DECR1Q16698 335 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 LRRC36Q1X8D7 754 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 C17orf58Q2M2W7 97 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 INAVAQ3KP66 663 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 POM121L1PQ3SYA9 428 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 PAGE3Q5JUK9 113 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 LCN1P1Q5VSP4 162 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 RRAGBQ5VZM2 374 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 FBXW9Q5XUX1 488 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 GGNBP1Q5YKI7 109 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 SLC22A10Q63ZE4 541 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 OR5M10Q6IEU7 315 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 AADACL2Q6P093 401 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 TATDN1Q6P1N9 297 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 SPINT4Q6UDR6 99 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 CYHR1Q6ZMK1 362 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 KDM7AQ6ZMT4 941 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 LEKR1Q6ZMV7 388 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 MOB3CQ70IA8 216 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 MOB1BQ7L9L4 216 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 KRT74Q7RTS7 529 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ASCL5Q7RTU5 278 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 TBC1D26Q86UD7 250 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 UBALD2Q8IYN6 164 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 KIAA2013Q8IYS2 634 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 GHDCQ8N2G8 530 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 FBXW8Q8N3Y1 598 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 RASGEF1CQ8N431 466 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 L3MBTL4Q8NA19 623 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 LY6G5BQ8NDX9 201 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 SETD9Q8NE22 299 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 OR5T2Q8NGG2 359 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 OR13C3Q8NGS6 347 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 OR8K5Q8NH50 307 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 MUC7Q8TAX7 377 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 TBCKQ8TEA7 893 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 PPP4R1Q8TF05 950 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 C7orf33Q8WU49 177 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 USP6NLQ92738 828 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 APBB2Q92870 758 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 TNFRSF14Q92956 283 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 SNAPC3Q92966 411 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 C11orf52Q96A22 123 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 GRAMD1AQ96CP6 724 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 NEURL3Q96EH8 262 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 FAM210BQ96KR6 192 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 AK8Q96MA6 479 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ZNF75AQ96N20 296 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 TWNKQ96RR1 684 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 SIN3AQ96ST3 1273 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 EYA3Q99504 573 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 RNF5Q99942 180 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 SH3GL2Q99962 352 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 SULT4A1Q9BR01 284 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 MECRQ9BV79 373 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 NUP85Q9BW27 656 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 TTTY12Q9BZ98 90 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 OR2B2Q9GZK3 357 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 CLPBQ9H078 707 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 CCDC134Q9H6E4 229 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 PTGES2Q9H7Z7 377 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 DCLRE1BQ9H816 532 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 SAYSD1Q9NPB0 183 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 CHST12Q9NRB3 414 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 SMYD2Q9NRG4 433 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 OSER1Q9NX31 292 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1250P-201ENST00000391218 MIOSQ9NXC5 875 aa-0.75□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms