RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366976.3

NSL1-201, Transcript of NSL1, MIS12 kinetochore complex component, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NSL1, Length 722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSL1-201ENST00000366976 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 RHAGQ02094 409 aa14.66□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 TGM3Q08188 693 aa14.66□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 DLG1Q12959 904 aa14.66□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 TLR1Q15399 786 aa14.66□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 DEFB134Q4QY38 66 aa14.66□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 MROH9Q5TGP6 573 aa14.66□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 H3F3CQ6NXT2 135 aa14.66□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 CLEC18BQ6UXF7 455 aa14.66□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 QSOX2Q6ZRP7 698 aa14.66□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 CMC1Q7Z7K0 106 aa14.66□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 PARP9Q8IXQ6 854 aa14.66□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 LAS2Q8IYD9 372 aa14.66□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 SPATA6LQ8N4H0 392 aa14.66□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 CLEC18CQ8NCF0 446 aa14.66□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 M1APQ8TC57 530 aa14.66□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 PSMF1Q92530 271 aa14.66□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 MARVELD3Q96A59 401 aa14.66□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 MOCOSQ96EN8 888 aa14.66□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 MACROD1Q9BQ69 325 aa14.66□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 ROGDIQ9GZN7 287 aa14.66□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 ALG9Q9H6U8 611 aa14.66□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 ZNF160Q9HCG1 818 aa14.66□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 SNX15Q9NRS6 342 aa14.66□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 LANCL2Q9NS86 450 aa14.66□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 BLACEA4D250 179 aa14.65□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 CHST10O43529 356 aa14.65□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 VPS4BO75351 444 aa14.65□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 RDH16O75452 317 aa14.65□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 RNH1P13489 461 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 EPB42P16452 691 aa14.65□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 HNF4AP41235 474 aa14.65□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 TSFMP43897 325 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 HSPA7P48741 367 aa14.65□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 DOC2AQ14183 400 aa14.65□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 RCN2Q14257 317 aa14.65□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.066e-8■□□□□ 10.7
NSL1-201ENST00000366976 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 SYT16Q17RD7 645 aa14.65□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa14.65□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 MINDY4Q4G0A6 757 aa14.65□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 TMEM35AQ53FP2 167 aa14.65□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 LIPJQ5W064 366 aa14.65□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 PRSS58Q8IYP2 241 aa14.65□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 LGI4Q8N135 537 aa14.65□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 OR2L5Q8NG80 312 aa14.65□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa14.65□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 C8orf44Q96CB5 159 aa14.65□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 NXNL1Q96CM4 212 aa14.65□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 MS4A6EQ96DS6 147 aa14.65□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 MTBPQ96DY7 904 aa14.65□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 FAR2Q96K12 515 aa14.65□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 GPR78Q96P69 363 aa14.65□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 SLC29A3Q9BZD2 475 aa14.65□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 MMP25Q9NPA2 562 aa14.65□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 OPTCQ9UBM4 332 aa14.65□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 VPS4AQ9UN37 437 aa14.65□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 MMACHCQ9Y4U1 282 aa14.65□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa14.65□□□□□ -0.06
NSL1-201ENST00000366976 DYTNA2CJ06 578 aa14.64□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 MSH2P43246 934 aa14.64□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 HSD17B7P56937 341 aa14.64□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 IRF8Q02556 426 aa14.64□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 SETDB1Q15047 1291 aa14.64□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 TERF2Q15554 542 aa14.64□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 NSDHLQ15738 373 aa14.64□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 INAQ16352 499 aa14.64□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 XKR6Q5GH73 641 aa14.64□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 TIFABQ6ZNK6 161 aa14.64□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 ANKRD37Q7Z713 158 aa14.64□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 LPAR4Q99677 370 aa14.64□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 HCN3Q9P1Z3 774 aa14.64□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 PPT2Q9UMR5 302 aa14.64□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa14.64□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 FLNCQ14315 2725 aa14.63□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa14.63□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 PRMT3O60678 531 aa14.63□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 ACSL3O95573 720 aa14.63□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 SERPIND1P05546 499 aa14.63□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 EPORP19235 508 aa14.63□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 PIK3CBP42338 1070 aa14.63□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 MLLT10P55197 1068 aa14.63□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 CHIT1Q13231 466 aa14.63□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 BIKQ13323 160 aa14.63□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 RAPSNQ13702 412 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms