RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364561.1

RNU6-1277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1277P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LRRC32Q14392 662 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 EPHA7Q15375 998 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 YIF1BQ5BJH7 314 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ELFN2Q5R3F8 820 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LIN9Q5TKA1 542 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KANK2Q63ZY3 851 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KIAA1841Q6NSI8 718 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MTHFD1LQ6UB35 978 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RNF144BQ7Z419 303 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZFAND4Q86XD8 727 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HOGA1Q86XE5 327 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TMC8Q8IU68 726 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CNTROBQ8N137 903 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SIX5Q8N196 739 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SVOPLQ8N434 492 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TTC39CQ8N584 583 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C11orf72Q8NBR9 251 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OR52M1Q8NGK5 317 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SNX29Q8TEQ0 813 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FAR1Q8WVX9 515 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CLEC4DQ8WXI8 215 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PIGKQ92643 395 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TANKQ92844 425 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 BRF1Q92994 677 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TOP1MTQ969P6 601 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CREB3L1Q96BA8 519 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C10orf90Q96M02 699 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C3orf30Q96M34 536 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF558Q96NG5 402 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF570Q96NI8 536 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ACTRT3Q9BYD9 372 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CSTL1Q9H114 145 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZSCAN32Q9NX65 697 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CLDND1Q9NY35 253 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PODXL2Q9NZ53 605 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TJP2Q9UDY2 1190 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 VPS51Q9UID3 782 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HAO1Q9UJM8 370 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FEM1BQ9UK73 627 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 WDR37Q9Y2I8 494 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SIGLEC9Q9Y336 463 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 L3MBTL1Q9Y468 752 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DTNAQ9Y4J8 743 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SNX9Q9Y5X1 595 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FAM234BA2RU67 622 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LRRD1A4D1F6 860 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DPPA5A6NC42 116 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ENO4A6NNW6 628 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C5orf67F2Z3F1 127 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 UBXN8O00124 270 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MANBAO00462 879 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PIRO00625 290 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SURF4O15260 269 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CLOCKO15516 846 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PPIP5K2O43314 1243 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PRAMEF2O60811 474 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ENTPD6O75354 484 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TRIM37O94972 964 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CLSTN1O94985 981 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MFN2O95140 757 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 VNN1O95497 513 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CH25HO95992 272 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NGFP01138 241 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PIGRP01833 764 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 THP07101 528 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CT62P0C5K7 136 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CA4P22748 312 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FPR2P25090 351 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 UCP1P25874 307 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PCSK1P29120 753 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HOXA9P31269 272 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LIPAP38571 399 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SYKP43405 635 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LGALS7P47929 136 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TMED10P49755 219 aaKnown RBP-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CLCN2P51788 898 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 COPB1P53618 953 aaKnown RBP-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PNLIPRP1P54315 467 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 EIF5P55010 431 aaKnown RBP-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 APBA1Q02410 837 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C17orf67Q0P5P2 114 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GPR17Q13304 367 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ASAH1Q13510 395 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RAB31Q13636 194 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PTK6Q13882 451 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DUSP6Q16828 381 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TMEM241Q24JQ0 296 aa-2.51□□□□□ -2.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms