RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 ISLR2Q6UXK2 745 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 LANCL3Q6ZV70 420 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 ABHD13Q7L211 337 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 GPSM1Q86YR5 675 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 TCAIMQ8N3R3 496 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 SPATA6LQ8N4H0 392 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 FAM26EQ8N5C1 309 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 SIRT6Q8N6T7 355 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 ANKRD53Q8N9V6 530 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 TRPV3Q8NET8 790 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 OR5T3Q8NGG3 340 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 DNAJB14Q8TBM8 379 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 NT5CQ8TCD5 201 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 RHBDF1Q96CC6 855 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 C19orf60Q96EN9 201 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 PKNOX2Q96KN3 472 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 OR1F2PQ96R84 312 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 PAFAH2Q99487 392 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM79Q9BSE2 394 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 TUBB6Q9BUF5 446 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 NMRAL1Q9HBL8 299 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 WWOXQ9NZC7 414 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 PTGFRNQ9P2B2 879 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 RNF112Q9ULX5 631 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 ACOT9Q9Y305 439 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 SVILO95425 2214 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 DYTNA2CJ06 578 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 OR2W5A6NFC9 320 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 URADA6NGE7 173 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 TCP11X1B4DZS4 312 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 WFS1O76024 890 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 B3GALT4O96024 378 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 S100BP04271 92 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 FHP07954 510 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 SLC35E2BP0CK96 405 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 ITGAMP11215 1152 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 COL6A2P12110 1019 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 ICAM2P13598 275 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 IL10P22301 178 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 JAK1P23458 1154 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 TYK2P29597 1187 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 GMPRP36959 345 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 HNF4AP41235 474 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 GDF5P43026 501 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 TSFMP43897 325 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
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SGMS1-201ENST00000361543 AGTR2P50052 363 aa7.22□□□□□ -1.25
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SGMS1-201ENST00000361543 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 ABRAXAS2Q15018 415 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 TLR1Q15399 786 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 NR6A1Q15406 480 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 ANKRD37Q7Z713 158 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 CMC1Q7Z7K0 106 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 CROCCP2Q86T23 111 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
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SGMS1-201ENST00000361543 STAG3L4Q8TBR4 150 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 PSMF1Q92530 271 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 EXT2Q93063 718 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 TSLPQ969D9 159 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 CAVIN3Q969G5 261 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 TBC1D20Q96BZ9 403 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 PEX11GQ96HA9 241 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 UBXN10Q96LJ8 280 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 IMMP1LQ96LU5 166 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 LMF1Q96S06 567 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 CAPS2Q9BXY5 557 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 SLC6A16Q9GZN6 736 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 ALG9Q9H6U8 611 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 LANCL2Q9NS86 450 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 DNAJC11Q9NVH1 559 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 ASF1BQ9NVP2 202 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 CD274Q9NZQ7 290 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 TMCO1Q9UM00 188 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 NTNG1Q9Y2I2 539 aa7.22□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
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