RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356924.8

ABCD4-201, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ABCD4, Length 3,003 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-201ENST00000356924 TSSK3Q96PN8 268 aa10.64□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 ZBTB18Q99592 522 aa10.64□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 DOK1Q99704 481 aa10.64□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa10.64□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 SNX13Q9Y5W8 968 aa10.64□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa10.64□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 DGKBQ9Y6T7 804 aa10.64□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 TRIM64CA6NLI5 447 aa10.64□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 DCKP27707 260 aa10.64□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 ACTR1BP42025 376 aa10.64□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 ACTR1AP61163 376 aa10.64□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 REEP5Q00765 189 aa10.64□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 FZD2Q14332 565 aa10.64□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 KRT33BQ14525 404 aa10.64□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa10.64□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 OR4K1Q8NGD4 311 aa10.64□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 LRTOMTQ8WZ04 291 aa10.64□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 SLC6A18Q96N87 628 aa10.64□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 SLC29A1Q99808 456 aa10.64□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa10.64□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 TRIM8Q9BZR9 551 aa10.64□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 KLHL25Q9H0H3 589 aa10.64□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 KLF15Q9UIH9 416 aa10.64□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 DAPK2Q9UIK4 370 aa10.64□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 NOX1Q9Y5S8 564 aa10.64□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 PLOD2O00469 737 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 TNFP01375 233 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 NUDT1P36639 197 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 CAMK2BQ13554 666 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 TMEM26Q6ZUK4 368 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 KIAA2013Q8IYS2 634 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 RAB42Q8N4Z0 105 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 OR2A1Q8NGT9 310 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 HPS1Q92902 700 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 SH3KBP1Q96B97 665 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 CIB1Q99828 191 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 SIRT5Q9NXA8 310 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 CORINQ9Y5Q5 1042 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 KLHL18O94889 574 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 TGFB1P01137 390 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 IL6P05231 212 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 THEGLP0DJG4 465 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 PIK3CBP42338 1070 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 PMS2P3Q13401 168 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 C6orf10Q5SRN2 563 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 KRT78Q8N1N4 520 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 SPEM1Q8N4L4 309 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 PJA1Q8NG27 643 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 GPBAR1Q8TDU6 330 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 SLC13A3Q8WWT9 602 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 GTF2H4Q92759 462 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 UBE2E3Q969T4 207 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 PCDHAC1Q9H158 963 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 RHBGQ9H310 441 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 NT5DC2Q9H857 520 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 INVSQ9Y283 1065 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 LRATO95237 230 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 NPPAP01160 153 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 PGRP06401 933 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 SLC19A1P41440 591 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 CCR8P51685 355 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 C21orf58P58505 322 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 CSNK1G2P78368 415 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 ACSM2AQ08AH3 577 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 PWP1Q13610 501 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 ACSM2BQ68CK6 577 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 GALNT18Q6P9A2 607 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 DEFB119Q8N690 84 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 ANKRD53Q8N9V6 530 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 DNAJB14Q8TBM8 379 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 SNX19Q92543 992 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 TESCQ96BS2 214 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 ASB9Q96DX5 294 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 CTRCQ99895 268 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 EFHD1Q9BUP0 239 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 OR51B5Q9H339 312 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 SPHK1Q9NYA1 384 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 EML5Q05BV3 1969 aa10.63□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 A6NL46 340 aa10.62□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 METTL12A8MUP2 240 aa10.62□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 H7BY64 318 aa10.62□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 BCL10O95999 233 aa10.62□□□□□ -0.71
ABCD4-201ENST00000356924 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms