RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338546.9

HPS1-202, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS1, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-202ENST00000338546 KLC1Q07866 573 aa15.53■□□□□ 0.08
HPS1-202ENST00000338546 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
HPS1-202ENST00000338546 FZD2Q14332 565 aa15.53■□□□□ 0.08
HPS1-202ENST00000338546 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
HPS1-202ENST00000338546 IQCHQ86VS3 1027 aa15.53■□□□□ 0.08
HPS1-202ENST00000338546 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa15.53■□□□□ 0.08
HPS1-202ENST00000338546 SPEM1Q8N4L4 309 aa15.53■□□□□ 0.08
HPS1-202ENST00000338546 OR4E2Q8NGC2 313 aa15.53■□□□□ 0.08
HPS1-202ENST00000338546 CCL4L1Q8NHW4 92 aa15.53■□□□□ 0.08
HPS1-202ENST00000338546 DPH7Q9BTV6 452 aa15.53■□□□□ 0.08
HPS1-202ENST00000338546 PIF1Q9H611 641 aa15.53■□□□□ 0.08
HPS1-202ENST00000338546 MAGIXQ9H6Y5 334 aa15.53■□□□□ 0.08
HPS1-202ENST00000338546 TPT1P8Q9HAU6 139 aa15.53■□□□□ 0.08
HPS1-202ENST00000338546 BATF3Q9NR55 127 aa15.53■□□□□ 0.08
HPS1-202ENST00000338546 SPASTQ9UBP0 616 aa15.53■□□□□ 0.08
HPS1-202ENST00000338546 FBXL21Q9UKT6 434 aa15.53■□□□□ 0.08
HPS1-202ENST00000338546 USP22Q9UPT9 525 aa15.53■□□□□ 0.08
HPS1-202ENST00000338546 KLK4Q9Y5K2 254 aa15.53■□□□□ 0.08
HPS1-202ENST00000338546 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa15.53■□□□□ 0.08
HPS1-202ENST00000338546 METTL12A8MUP2 240 aa15.52■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 ISM1B1AKI9 464 aa15.52■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 YY2O15391 372 aa15.52■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 TNFSF14O43557 240 aa15.52■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 DENRO43583 198 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 CREG1O75629 220 aa15.52■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 TIPRLO75663 272 aa15.52■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 VIPP01282 170 aa15.52■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 IL3P08700 152 aa15.52■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 CD27P26842 260 aa15.52■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 CHRNB3Q05901 458 aa15.52■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 VEZF1Q14119 521 aa15.52■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 ATP6AP1Q15904 470 aa15.52■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 OR4C11Q6IEV9 310 aa15.52■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 HMBOX1Q6NT76 420 aa15.52■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 PARGQ86W56 976 aa15.52■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 PAQR7Q86WK9 346 aa15.52■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 TRIM48Q8IWZ4 208 aa15.52■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 CLECL1Q8IZS7 167 aa15.52■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 MFSD2AQ8NA29 543 aa15.52■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 FAM47BQ8NA70 645 aa15.52■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 AVL9Q8NBF6 648 aa15.52■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 ZFP90Q8TF47 636 aa15.52■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 FIG4Q92562 907 aa15.52■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 CLDN23Q96B33 292 aa15.52■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 TM4SF18Q96CE8 201 aa15.52■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 THAP11Q96EK4 314 aa15.52■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 RAD21L1Q9H4I0 556 aa15.52■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 MIEF1Q9NQG6 463 aa15.52■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 SPHK1Q9NYA1 384 aa15.52■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 TAAR2Q9P1P5 351 aa15.52■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 SCAMP1O15126 338 aa15.51■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 NDUFS2O75306 463 aa15.51■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 GUCY1B2O75343 617 aa15.51■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 DRD2P14416 443 aa15.51■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 BCL6P41182 706 aa15.51■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 CLCN2P51788 898 aa15.51■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 CYP4F2P78329 520 aa15.51■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 MED21Q13503 144 aa15.51■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa15.51■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 PPP4R4Q6NUP7 873 aa15.51■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 OR4A15Q8NGL6 344 aa15.51■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 FAM162AQ96A26 154 aa15.51■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 TBCDQ9BTW9 1192 aa15.51■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 BDH2Q9BUT1 245 aa15.51■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 C9orf16Q9BUW7 83 aa15.51■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa15.51■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 C2orf42Q9NWW7 574 aa15.51■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 TAS2R7Q9NYW3 318 aa15.51■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 ERVK-11Q9UQG0 969 aa15.51■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa15.51■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 A0A0A6YYD5 115 aa15.5■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa15.5■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 BTN3A3O00478 584 aa15.5■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 KCNK5O95279 499 aa15.5■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 B3GALT4O96024 378 aa15.5■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 LDLRP01130 860 aa15.5■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 GBAP04062 536 aa15.5■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 RPS9P46781 194 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 CCT8P50990 548 aa15.5■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 TGM3Q08188 693 aa15.5■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 VMACQ2NL98 169 aa15.5■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 ZNF385BQ569K4 471 aa15.5■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 PRRT3Q5FWE3 981 aa15.5■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa15.5■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 UBE3DQ7Z6J8 389 aa15.5■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 UBALD2Q8IYN6 164 aa15.5■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 FBXL6Q8N531 539 aa15.5■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 ZNF597Q96LX8 424 aa15.5■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 KCNC2Q96PR1 638 aa15.5■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 IER2Q9BTL4 223 aa15.5■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 CHID1Q9BWS9 393 aa15.5■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 LHX9Q9NQ69 397 aa15.5■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 TAS2R9Q9NYW1 312 aa15.5■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 EHD3Q9NZN3 535 aa15.5■□□□□ 0.07
HPS1-202ENST00000338546 CPNE7Q9UBL6 633 aa15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.4 ms