RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 CNPY1Q3B7I2 92 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 CDH11P55287 796 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 CARD17Q5XLA6 110 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 CA14Q9ULX7 337 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 UBR1Q8IWV7 1749 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 CDRT1O95170 752 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 PLEKHG6Q3KR16 790 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 CYBRD1Q53TN4 286 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 OR8K3Q8NH51 312 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 DOK4Q8TEW6 326 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 KIAA1191Q96A73 305 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 VSTM5A8MXK1 200 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 HTR1AP08908 422 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 TGM7Q96PF1 710 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 NPY6RQ99463 290 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 BRF2Q9HAW0 419 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 PCLAFQ15004 111 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 FLYWCH1Q4VC44 716 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC107Q8WV48 283 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 SLC22A4Q9H015 551 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 FAM221BA6H8Z2 402 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 FAM72CH0Y354 149 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 ELOCQ15369 112 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 FAM72AQ5TYM5 149 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 FAM72DQ6L9T8 149 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 FAM72BQ86X60 149 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 SPHK2Q9NRA0 654 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 WDR45Q9Y484 360 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 PCP4L1A6NKN8 68 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 C2orf74A8MZ97 194 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF805Q5CZA5 627 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 PLCZ1Q86YW0 608 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF565Q8N9K5 539 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 OR5T2Q8NGG2 359 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 HCN2Q9UL51 889 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 TSPAN6O43657 245 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF542PQ5EBM4 170 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 BEND4Q6ZU67 534 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 TTLL10Q6ZVT0 673 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 PAQR7Q86WK9 346 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 PTGES2Q9H7Z7 377 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 LCHNA4D1U4 455 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 IGDCC3Q8IVU1 814 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 IRS2Q9Y4H2 1338 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 DLDP09622 509 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 NNATQ16517 81 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 PPP1R3AQ16821 1122 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 TMED4Q7Z7H5 227 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 ZBTB26Q9HCK0 441 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 GPR34Q9UPC5 381 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 C2orf78A6NCI8 922 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 SCO2O43819 266 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 PFKMP08237 780 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 TPTEP56180 551 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 BLMHQ13867 455 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 MEP1AQ16819 746 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 PLEKHO2Q8TD55 490 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 GPR174Q9BXC1 333 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 MED11Q9P086 117 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 A0A1B0GVI7 797 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 RAB36O95755 333 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 DCSTAMPQ9H295 470 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 PIRO00625 290 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 BPNT1O95861 308 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 FAM163BP0C2L3 166 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 OR12D1P0DN82 309 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 GADD45AP24522 165 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 RPS21P63220 83 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 IRF5Q13568 498 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 SSX6Q7RTT6 188 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 PLCL2Q9UPR0 1127 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 KDM4BO94953 1096 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 CSF2RAP15509 400 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 GABRA3P34903 492 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 DENND1AQ8TEH3 1009 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 FZD3Q9NPG1 666 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 FANCFQ9NPI8 374 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 EDNRBP24530 442 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 M0R2N6 131 aa21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms