RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327331.2

CDCA8-201, Transcript of cell division cycle associated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CDCA8, Length 2,303 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8-201ENST00000327331 FRG2BQ96QU4 278 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 EBPLQ9BY08 206 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 SPHK1Q9NYA1 384 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 PSME2Q9UL46 239 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 SNX6Q9UNH7 406 aa11.13□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 A0A1W2PPV9 198 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 A8MU76 341 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 H7BY64 318 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 CLOCKO15516 846 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 RGS14O43566 566 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 SDC3O75056 442 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 CPNE6O95741 557 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 CLIC3O95833 236 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 CTSEP14091 401 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 CD27P26842 260 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 SLC19A1P41440 591 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 TPTEP56180 551 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 ERVK-8P63133 956 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 CYP4F2P78329 520 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 VPS26BQ4G0F5 336 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 MIER2Q8N344 545 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 ABHD11Q8NFV4 315 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 VPS33AQ96AX1 596 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 CLIP3Q96DZ5 547 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 PRAP1Q96NZ9 151 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 SLC29A3Q9BZD2 475 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 RAD21L1Q9H4I0 556 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 IL1RL2Q9HB29 575 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 LRTM1Q9HBL6 345 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 TM9SF3Q9HD45 589 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 TAAR2Q9P1P5 351 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 GPR45Q9Y5Y3 372 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 PRORSD1PA6NEY8 169 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 MAGEB17A8MXT2 336 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 TNFRSF10CO14798 259 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 JUNDP17535 347 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 CD38P28907 300 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 IL12AP29459 219 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 CCT8P50990 548 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 PLIN5Q00G26 463 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 GGTA1PQ4G0N0 100 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 GRHL2Q6ISB3 625 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 ADCK2Q7Z695 626 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 EPHX4Q8IUS5 362 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 OFCC1Q8IZS5 231 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 CAMKK1Q8N5S9 505 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 GPR156Q8NFN8 814 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 OR7G3Q8NG95 312 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 HUS1BQ8NHY5 278 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 RAB2BQ8WUD1 216 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 CXorf40BQ96DE9 158 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 SPACA7Q96KW9 195 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 APOLD1Q96LR9 279 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 HMG20AQ9NP66 347 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 AIG1Q9NVV5 245 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa11.12□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 PIPSLA2A3N6 862 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 B4DGG1 531 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 VPS4BO75351 444 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 GBAP04062 536 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 CAPN3P20807 821 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 NR4A1P22736 598 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 OCA2Q04671 838 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 LRP8Q14114 963 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 PGS1Q32NB8 556 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 C6orf10Q5SRN2 563 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 LIPJQ5W064 366 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 NXPE4Q6UWF7 544 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 TRIM46Q7Z4K8 759 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 PARGQ86W56 976 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 LIX1Q8N485 282 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 CDC26Q8NHZ8 85 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 WDR20Q8TBZ3 569 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 FAM110BQ8TC76 370 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 CANT1Q8WVQ1 401 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 SLC39A3Q9BRY0 314 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 LRRC61Q9BV99 259 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 TRIM8Q9BZR9 551 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 FANCEQ9HB96 536 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 ARMC1Q9NVT9 282 aa11.11□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa11.1□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 A0A1W2PR77 199 aa11.1□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 A6NCN8 305 aa11.1□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 SLC28A1O00337 649 aa11.1□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 SEC14L2O76054 403 aa11.1□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 LRATO95237 230 aa11.1□□□□□ -0.63
CDCA8-201ENST00000327331 TGFB1P01137 390 aa11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms