RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295874.14

PTPRG-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRG, Length 4,650 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-201ENST00000295874 CYBAP13498 195 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRG-201ENST00000295874 SPIBQ01892 262 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRG-201ENST00000295874 PAGE3Q5JUK9 113 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRG-201ENST00000295874 FOXB2Q5VYV0 432 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRG-201ENST00000295874 OR2T5Q6IEZ7 315 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRG-201ENST00000295874 C17orf99Q6UX52 265 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRG-201ENST00000295874 CYP2U1Q7Z449 544 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRG-201ENST00000295874 OR2T29Q8NH02 315 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRG-201ENST00000295874 BPIFB1Q8TDL5 484 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRG-201ENST00000295874 TRIB2Q92519 343 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRG-201ENST00000295874 PIGKQ92643 395 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRG-201ENST00000295874 TMIGD2Q96BF3 282 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRG-201ENST00000295874 PYURFQ96I23 114 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRG-201ENST00000295874 PTPN18Q99952 460 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRG-201ENST00000295874 TLR9Q9NR96 1032 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRG-201ENST00000295874 CD300AQ9UGN4 299 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRG-201ENST00000295874 PLCL2Q9UPR0 1127 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRG-201ENST00000295874 PRELID1Q9Y255 219 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRG-201ENST00000295874 RNF11Q9Y3C5 154 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRG-201ENST00000295874 OARD1Q9Y530 152 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRG-201ENST00000295874 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRG-201ENST00000295874 NUP205Q92621 2012 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRG-201ENST00000295874 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
PTPRG-201ENST00000295874 TNFRSF10BO14763 440 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRG-201ENST00000295874 ADAMDEC1O15204 470 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRG-201ENST00000295874 COCHO43405 550 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRG-201ENST00000295874 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
PTPRG-201ENST00000295874 NT5EP21589 574 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRG-201ENST00000295874 DPP6P42658 865 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
PTPRG-201ENST00000295874 NAE1Q13564 534 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRG-201ENST00000295874 PTGR1Q14914 329 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRG-201ENST00000295874 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP11.9□□□□□ -0.51e-6■■■■□ 26.1
PTPRG-201ENST00000295874 LDLRAP1Q5SW96 308 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRG-201ENST00000295874 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRG-201ENST00000295874 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRG-201ENST00000295874 OR4A15Q8NGL6 344 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRG-201ENST00000295874 hCG_2039718K7EN88 272 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 DNAJB5O75953 348 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 PGLSO95336 258 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 GJB5O95377 273 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 CLDN7O95471 211 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 LAMP2P13473 410 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 HMGCLP35914 325 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 CTSKP43235 329 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 ERVPABLB-1P60509 514 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 FAPQ12884 760 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 RHEBQ15382 184 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 FAM189A2Q15884 450 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 LCN1P1Q5VSP4 162 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 MLIPQ5VWP3 458 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 FRG2Q64ET8 278 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 TMEM17Q86X19 198 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 POC1BQ8TC44 478 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 FRG2BQ96QU4 278 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 HPF1Q9NWY4 346 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 SARDHQ9UL12 918 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 BRWD3Q6RI45 1802 aa11.9□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 CLIC1O00299 241 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 MID1O15344 667 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 TIE1P35590 1138 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 PNLIPRP1P54315 467 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 MVKQ03426 396 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 PCDH1Q08174 1060 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 NFATC2Q13469 925 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 PDSS1Q5T2R2 415 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 XKR5Q6UX68 686 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 CD200R1Q8TD46 325 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 PMM1Q92871 262 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 PPCDCQ96CD2 204 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 OR2AT4A6NND4 320 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 CLPXO76031 633 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 SMIM18P0DKX4 95 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 IL7RP16871 459 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 GGT1P19440 569 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP11.89□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 GGT5P36269 586 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 SLC25A25Q6KCM7 469 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 NXPE1Q8N323 547 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 TTC9BQ8N6N2 239 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 OR2AP1Q8NGE2 309 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 CEP76Q8TAP6 659 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 KCNH6Q9H252 994 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 MAT2BQ9NZL9 334 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 IFNA21P01568 189 aa11.89□□□□□ -0.51
PTPRG-201ENST00000295874 HOXB2P14652 356 aa11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms