RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 CLYBLQ8N0X4 340 aa19.52■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM105Q8N8V8 129 aa19.52■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 SUN5Q8TC36 379 aa19.52■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 OR2M4Q96R27 311 aa19.52■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 TRMOQ9BU70 441 aa19.52■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 ANAPC2Q9UJX6 822 aa19.52■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa19.51■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 PTGES3LE9PB15 166 aa19.51■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 TNFRSF10CO14798 259 aa19.51■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 PIP5K1BO14986 540 aa19.51■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 ANGPT2O15123 496 aa19.51■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 LAMTOR5O43504 91 aa19.51■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 THEGLP0DJG4 465 aa19.51■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 MAGP20916 626 aa19.51■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 BDKRB1P46663 353 aa19.51■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 TRPC1P48995 793 aa19.51■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 VBP1P61758 197 aa19.51■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 MEP1AQ16819 746 aa19.51■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 ALG11Q2TAA5 492 aa19.51■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 WDR45BQ5MNZ6 344 aa19.51■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 LINC00299Q6ZSB3 139 aa19.51■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 RD3Q7Z3Z2 195 aa19.51■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 TMEFF1Q8IYR6 380 aa19.51■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 TBC1D21Q8IYX1 336 aa19.51■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 GOLM1Q8NBJ4 401 aa19.51■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 EGFL8Q99944 293 aa19.51■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 MID1IP1Q9NPA3 183 aa19.51■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa19.51■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 PRR19A6NJB7 356 aa19.51■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 BBIP1A8MTZ0 92 aa19.51■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 FXYD1O00168 92 aa19.51■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 KRT8P05787 483 aa19.51■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 CYP2A7P20853 494 aa19.51■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 ACADLP28330 430 aa19.51■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 SRP54P61011 504 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 SIGIRRQ6IA17 410 aa19.51■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 PDZD3Q86UT5 571 aa19.51■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 CLEC4FQ8N1N0 589 aa19.51■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 RHBDF1Q96CC6 855 aa19.51■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 KCNA7Q96RP8 456 aa19.51■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa19.51■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 ARL15Q9NXU5 204 aa19.51■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 CCNKO75909 580 aa19.5■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 RPS17P08708 135 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 PRKCAP17252 672 aa19.5■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 SLC6A2P23975 617 aa19.5■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 PPP5CP53041 499 aa19.5■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 PAGE2Q7Z2X7 111 aa19.5■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 MIER2Q8N344 545 aa19.5■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 NDUFAF1Q9Y375 327 aa19.5■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 TAPBPO15533 448 aa19.5■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 MFN2O95140 757 aa19.5■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 ARSFP54793 590 aa19.5■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 TCEA2Q15560 299 aa19.5■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 CCSMST1Q4G0I0 132 aa19.5■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 PRMT9Q6P2P2 845 aa19.5■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 LYSMD2Q8IV50 215 aa19.5■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 C1orf210Q8IVY1 113 aa19.5■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 TWIST2Q8WVJ9 160 aa19.5■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 FOPNLQ96NB1 174 aa19.5■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa19.5■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa19.5■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa19.5■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa19.49■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 SLC22A1O15245 554 aa19.49■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 SCO2O43819 266 aa19.49■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 SPNP16150 400 aa19.49■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 IST1P53990 364 aa19.49■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 C6orf141Q5SZD1 244 aa19.49■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 SLX4IPQ5VYV7 408 aa19.49■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 SULT1C3Q6IMI6 304 aa19.49■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 WDR5BQ86VZ2 330 aa19.49■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 MCOLN3Q8TDD5 553 aa19.49■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 SDCCAG3Q96C92 435 aa19.49■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 RNF145Q96MT1 663 aa19.49■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 BDH2Q9BUT1 245 aa19.49■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa19.49■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 TRIM54Q9BYV2 358 aa19.49■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa19.49■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF639Q9UID6 485 aa19.49■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 BTRCQ9Y297 605 aa19.49■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 GON4LQ3T8J9 2241 aa19.49■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa19.49■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 TBX1O43435 398 aa19.49■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 C1orf105O95561 183 aa19.49■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 CATP04040 527 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 WNT1P04628 370 aa19.49■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 NTRK1P04629 796 aa19.49■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 ANXA5P08758 320 aa19.49■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 THRBP10828 461 aa19.49■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 HIST1H2ADP20671 130 aa19.49■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 MAPK9P45984 424 aa19.49■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 KRT6CP48668 564 aa19.49■□□□□ 0.71
UBE2B-201ENST00000265339 FZD2Q14332 565 aa19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms